Marc Thilo Figge

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Zoltan CseresnyesResearch Associate, Hans-Knöll-Institute, JenaBestätigte E-Mail-Adresse bei hki-jena.de
Carl-Magnus SvenssonLeibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie e. V. – Hans-Knöll-Institut (HKI)Bestätigte E-Mail-Adresse bei leibniz-hki.de
Anna MedyukhinaCenter for Bioimage Informatics, St. Jude Children's Research HospitalBestätigte E-Mail-Adresse bei stjude.org
Michael Meyer-HermannProfessor of Theoretical BiologyBestätigte E-Mail-Adresse bei helmholtz-hzi.de
Hans De RaedtProfessor of Computational Physics, University of GroningenBestätigte E-Mail-Adresse bei rug.nl
Zipfel Peter FLeibniz Institute for Natural Product Research and Infection BiologyBestätigte E-Mail-Adresse bei hki-jena.de
Ilse JacobsenResearch Group Microbial Immunology, Leibniz Institute for Natural Product Research and InfectionBestätigte E-Mail-Adresse bei hki-jena.de
Bernhard HubeDepartment of Microbial Pathogenicity mechanisms - Hans Knöll InstituteBestätigte E-Mail-Adresse bei hki-jena.de
Kristel MichielsenJuelich Supercomputing Centre, Forschungszentrum Juelich, DEBestätigte E-Mail-Adresse bei fz-juelich.de
Adrian PressJuniorprofessor for Molecular Medicine of Life-Threatening Infections @Jena University HospitalBestätigte E-Mail-Adresse bei med.uni-jena.de
Alexander S. Mosiginspire lab @ Institute of Biochemistry, CSCC, Jena University HospitalBestätigte E-Mail-Adresse bei med.uni-jena.de
Kai-Michael ToellnerThe Babraham Institute, Cambridge, CB22 3AT, UK.Bestätigte E-Mail-Adresse bei babraham.ac.uk
Matthias GunzerProfessor for experimental Immunology, University Duisburg-Essen, University HospitalBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-due.de
Ruman GerstLeibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology – Hans Knöll Institute (HKI)Bestätigte E-Mail-Adresse bei leibniz-hki.de
Stephanie HoeppenerJCSM Research Group Leader Electron Microscopy, Friedrich Schiller University JenaBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-jena.de
Zeinab MokhtariPostdoctoral Fellow, Department of Medicine II, Würzburg University HospitalBestätigte E-Mail-Adresse bei ukw.de
Christian EggelingProfessor of Super-Resolution Microscopy, University Jena Germany & University of OxfordBestätigte E-Mail-Adresse bei rdm.ox.ac.uk
Ulrich S. SchubertFriedrich Schiller University Jena, Laboratory of Organic and Macromolecular Chemistry, Germany; MaxBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-jena.de
Miguel TovarLeibniz Institute for Natural Product Research and Infection BiologyBestätigte E-Mail-Adresse bei leibniz-hki.de
Marie von Lilienfeld-ToalFriedrich Schiller Universität JenaBestätigte E-Mail-Adresse bei med.uni-jena.de

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Marc Thilo Figge

Professor for Applied Systems Biology, Friedrich Schiller University Jena

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systems biology image data analysis host-pathogen interactions


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Fully automated evaluation of total glomerular number and capillary tuft size in nephritic kidneys using lightsheet microscopy A Klingberg, A Hasenberg, I Ludwig-Portugall, A Medyukhina, L Männ, ... Journal of the American Society of Nephrology 28 (2), 452-459, 2017	355	2017
Germinal center B cells govern their own fate via antibody feedback Y Zhang, M Meyer-Hermann, LA George, MT Figge, M Khan, M Goodall, ... Journal of Experimental Medicine 210 (3), 457-464, 2013	315	2013
Candida albicans-induced epithelial damage mediates translocation through intestinal barriers S Allert, TM Förster, CM Svensson, JP Richardson, T Pawlik, B Hebecker, ... MBio 9 (3), e00915-18, 2018	176*	2018
A three-dimensional immunocompetent intestine-on-chip model as in vitro platform for functional and microbial interaction studies M Maurer, MS Gresnigt, A Last, T Wollny, F Berlinghof, R Pospich, ... Biomaterials 220, 119396, 2019	152	2019
Toll-like receptor 4 signaling by follicular dendritic cells is pivotal for germinal center onset and affinity maturation A Garin, M Meyer-Hermann, M Contie, MT Figge, V Buatois, M Gunzer, ... Immunity 33 (1), 84-95, 2010	141	2010
Deceleration of fusion–fission cycles improves mitochondrial quality control during aging MT Figge, AS Reichert, M Meyer-Hermann, HD Osiewacz PLoS computational biology 8 (6), e1002576, 2012	117	2012
Real-time image processing for label-free enrichment of Actinobacteria cultivated in picolitre droplets E Zang, S Brandes, M Tovar, K Martin, F Mech, P Horbert, T Henkel, ... Lab on a Chip 13 (18), 3707-3713, 2013	116	2013
Deriving a germinal center lymphocyte migration model from two-photon data MT Figge, A Garin, M Gunzer, M Kosco-Vilbois, KM Toellner, ... Journal of experimental medicine 205 (13), 3019-3029, 2008	94	2008
A Virtual Infection Model Quantifies Innate Effector Mechanisms and Candida albicans Immune Escape in Human Blood K Hünniger, T Lehnert, K Bieber, R Martin, MT Figge, O Kurzai PLoS computational biology 10 (2), e1003479, 2014	84	2014
Untangling cell tracks: Quantifying cell migration by time lapse image data analysis CM Svensson, A Medyukhina, I Belyaev, N Al‐Zaben, MT Figge Cytometry Part A 93 (3), 357-370, 2018	78	2018
Enhanced and homogeneous oxygen availability during incubation of microfluidic droplets L Mahler, M Tovar, T Weber, S Brandes, MM Rudolph, J Ehgartner, ... Rsc Advances 5 (123), 101871-101878, 2015	77	2015
Mast cells acquire MHCII from dendritic cells during skin inflammation J Dudeck, A Medyukhina, J Fröbel, CM Svensson, J Kotrba, M Gerlach, ... Journal of Experimental Medicine 214 (12), 3791-3811, 2017	76	2017
Solving the Maxwell equations by the Chebyshev method: A one-step finite-difference time-domain algorithm H De Raedt, K Michielsen, JS Kole, MT Figge IEEE Transactions on Antennas and Propagation 51 (11), 3155-3160, 2003	76	2003
Co-infection with Staphylococcus aureus after primary influenza virus infection leads to damage of the endothelium in a human alveolus-on-a-chip model S Deinhardt-Emmer, K Rennert, E Schicke, Z Cseresnyés, M Windolph, ... Biofabrication 12 (2), 025012, 2020	75	2020
Unconditionally stable algorithms to solve the time-dependent Maxwell equations JS Kole, MT Figge, H De Raedt Physical Review E 64 (6), 066705, 2001	74	2001
Human neutrophils produce antifungal extracellular vesicles against Aspergillus fumigatus IA Shopova, I Belyaev, P Dasari, S Jahreis, MC Stroe, Z Cseresnyés, ... MBio 11 (2), 10.1128/mbio. 00596-20, 2020	68	2020
Bacterial endosymbionts protect beneficial soil fungus from nematode attack H Büttner, SP Niehs, K Vandelannoote, Z Cseresnyés, B Dose, I Richter, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 118 (37), e2110669118, 2021	66	2021
Automated detection of circulating tumor cells with naive Bayesian classifiers CM Svensson, S Krusekopf, J Lücke, MT Figge Cytometry Part A 85 (6), 501–511, 2014	66	2014
Automated image analysis of the host-pathogen interaction between phagocytes and Aspergillus fumigatus F Mech, A Thywißen, R Guthke, AA Brakhage, MT Figge PloS one 6 (5), e19591, 2011	65	2011
Automated classification of circulating tumor cells and the impact of interobsever variability on classifier training and performance CM Svensson, R Hübler, MT Figge Journal of immunology research 2015 (1), 573165, 2015	63	2015

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