Lars Schäfer

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Helmut GrubmullerTheoretical and Computational Biophysics Department, Max Planck Institute for MultidisciplinaryBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Siewert J. MarrinkProfessor of Molecular Dynamics, University of GroningenBestätigte E-Mail-Adresse bei rug.nl
Gerrit GroenhofDepartment of Chemistry & Nanoscience Center, University of JyväskyläBestätigte E-Mail-Adresse bei jyu.fi
Mike RobbChemistry Department Imperial CollegeBestätigte E-Mail-Adresse bei imperial.ac.uk
Guido CleverProfessor of Chemistry, TU Dortmund UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei tu-dortmund.de
Robert TampéProfessor of Biochemistry, Biocenter, Goethe University FrankfurtBestätigte E-Mail-Adresse bei em.uni-frankfurt.de
Enrica BordignonProfessor in Physical Chemistry, University of GenevaBestätigte E-Mail-Adresse bei unige.ch
Frans AA MulderJohannes Kepler UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei jku.at
Rasmus LinserTU Dortmund UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei tu-dortmund.de
Saumyak MukherjeePostdoctoral Research Associate, Max Planck Institute of BiophysicsBestätigte E-Mail-Adresse bei biophys.mpg.de
Stefan W. HellMax Planck Institute for Biophysical Chemistry, Max Planck Institute for Medical ResearchBestätigte E-Mail-Adresse bei gwdg.de
Dario De VecchisPostdoctoral fellow, Ruhr University BochumBestätigte E-Mail-Adresse bei ruhr-uni-bochum.de
Matthias HeydenArizona State UniversityBestätigte E-Mail-Adresse bei asu.edu
Gerhard HummerMax Planck Institute of BiophysicsBestätigte E-Mail-Adresse bei biophys.mpg.de
Martin ThanbichlerProfessor of Microbiology, Philipps University, MarburgBestätigte E-Mail-Adresse bei uni-marburg.de
Patrick NuernbergerProfessor für Physikalische Chemie, Universität RegensburgBestätigte E-Mail-Adresse bei ur.de
B.L. FeringaProfessor of Chemistry, University of GroningenBestätigte E-Mail-Adresse bei rug.nl
Jeremy C SmithUniversity of Tennessee KnoxvilleBestätigte E-Mail-Adresse bei ornl.gov
Martina HavenithProfessur RUBBestätigte E-Mail-Adresse bei rub.de
Jürgen SchlitterRuhr University BochumBestätigte E-Mail-Adresse bei rub.de

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Lars Schäfer

Professor, Ruhr University Bochum

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Theoretical Biophysical Chemistry Biophysics Biomolecular Simulation Comput. Structural Biology


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Improved parameters for the Martini coarse-grained protein force field DH de Jong, G Singh, WFD Bennett, C Arnarez, TA Wassenaar, ... Journal of Chemical Theory and Computation 9 (1), 687-697, 2013	1482	2013
Polarizable water model for the coarse-grained MARTINI force field SO Yesylevskyy, LV Schäfer, D Sengupta, SJ Marrink PLoS Computational Biology 6 (6), e1000810, 2010	979	2010
Mechanoenzymatics of titin kinase EM Puchner, A Alexandrovich, AL Kho, U Hensen, LV Schäfer, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 105 (36), 13385-13390, 2008	430	2008
Structure and mechanism of the reversible photoswitch of a fluorescent protein M Andresen, MC Wahl, AC Stiel, F Gräter, LV Schäfer, S Trowitzsch, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 102 (37), 13070-13074, 2005	329	2005
Lipid packing drives the segregation of transmembrane helices into disordered lipid domains in model membranes LV Schäfer, DH de Jong, A Holt, AJ Rzepiela, AH de Vries, B Poolman, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 108 (4), 1343-1348, 2011	276	2011
Reconstruction of atomistic details from coarse‐grained structures AJ Rzepiela, LV Schäfer, N Goga, HJ Risselada, AH de Vries, SJ Marrink Journal of Computational Chemistry 31 (6), 1333-1343, 2010	231	2010
Ultrafast deactivation of an excited cytosine−guanine base pair in DNA G Groenhof, LV Schäfer, M Boggio-Pasqua, M Goette, H Grubmüller, ... Journal of the American Chemical Society 129 (21), 6812-6819, 2007	187	2007
Mixing MARTINI: electrostatic coupling in hybrid atomistic–coarse-grained biomolecular simulations TA Wassenaar, HI Ingólfsson, M Prieß, SJ Marrink, LV Schäfer The Journal of Physical Chemistry B 117 (13), 3516-3530, 2013	179	2013
Surface hopping excited-state dynamics study of the photoisomerization of a light-driven fluorene molecular rotary motor A Kazaryan, Z Lan, LV Schäfer, W Thiel, M Filatov Journal of Chemical Theory and Computation 7 (7), 2189-2199, 2011	172	2011
High-concentration protein formulations: how high is high? P Garidel, AB Kuhn, LV Schäfer, AR Karow-Zwick, M Blech European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics 119, 353-360, 2017	157	2017
Ultrafast deactivation channel for thymine dimerization M Boggio-Pasqua, G Groenhof, LV Schäfer, H Grubmüller, MA Robb Journal of the American Chemical Society 129 (36), 10996-10997, 2007	157	2007
Transmembrane helices can induce domain formation in crowded model membranes J Domański, SJ Marrink, LV Schäfer Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Biomembranes 1818 (4), 984-994, 2012	141	2012
Cholesterol in bilayers with PUFA chains: doping with DMPC or POPC results in sterol reorientation and membrane-domain formation N Kucerka, D Marquardt, TA Harroun, MP Nieh, SR Wassall, DH De Jong, ... Biochemistry 49 (35), 7485-7493, 2010	141	2010
Photoswitching of the fluorescent protein asFP595: mechanism, proton pathways, and absorption spectra L Schäfer, G Groenhof, AR Klingen, GM Ullmann, M Boggio-Pasqua, ... Angewandte Chemie-International Edition 46 (4), 530-536, 2007	140	2007
Understanding the dynamics behind the photoisomerization of a light-driven fluorene molecular rotary motor A Kazaryan, JCM Kistemaker, LV Schäfer, WR Browne, BL Feringa, ... The Journal of Physical Chemistry A 114 (15), 5058-5067, 2010	133	2010
Chromophore protonation state controls photoswitching of the fluoroprotein asFP595 LV Schäfer, G Groenhof, M Boggio-Pasqua, MA Robb, H Grubmüller PLoS Computational Biology 4 (3), e1000034, 2008	121	2008
Influence of hydrophobic mismatch and amino acid composition on the lateral diffusion of transmembrane peptides S Ramadurai, A Holt, LV Schäfer, VV Krasnikov, DTS Rijkers, SJ Marrink, ... Biophysical Journal 99 (5), 1447-1454, 2010	106	2010
Arginine52 controls the photoisomerization process in photoactive yellow protein G Groenhof, LV Schäfer, M Boggio-Pasqua, H Grubmüller, MA Robb Journal of the American Chemical Society 130 (11), 3250-3251, 2008	100	2008
Partitioning of lipids at domain boundaries in model membranes LV Schäfer, SJ Marrink Biophysical Journal 99 (12), L91-L93, 2010	97	2010
A refined polarizable water model for the coarse-grained MARTINI force field with long-range electrostatic interactions J Michalowsky, LV Schäfer, C Holm, J Smiatek The Journal of Chemical Physics 146 (5), 054501, 2017	90	2017

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