Yifan Song

Παρατίθεται από

	Όλα	Από το 2020
Παραθέσεις	5990	3298
h-index	22	16
i10-index	25	20

720

360

180

540

2006200720082009201020112012201320142015201620172018201920202021202220232024202517 13 25 28 48 83 111 180 199 245 324 422 491 465 531 667 708 686 634 67

Δημόσια πρόσβαση

Προβολή όλων

21 άρθρα

1 άρθρο

διαθέσιμα

μη διαθέσιμα

Σύμφωνα με εντολές χρηματοδότησης

Συν-συγγραφείς

David BakerUniversity of WashingtonΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα uw.edu
Ray Yu-Ruei WangDE Shaw ResearchΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα deshawresearch.com
James ThompsonResearch Scientist, AmazonΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα uw.edu
Jane S. RichardsonProfessor of Biochemistry, Duke UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα duke.edu
Andrew Leaver-FayResearch Assistant Professor, Biochemistry, UNCΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα email.unc.edu
Daniel A. KeedyCUNY Advanced Science Research CenterΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα gc.cuny.edu
Geoffrey BerguigEvercrisp BiosciencesΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα evercrispbio.com
Erik ProckoAssociate Professor, University of Illinois at Urbana-ChampaignΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα illinois.edu
Sagar KhareAssistant Professor of Chemistry and Chemical Biology, Rutgers UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα rutgers.edu
Yakov KipnisPostdoctoral Research Associate at University of WashingtonΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα uw.edu
Tanja KortemmeUCSFΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα cgl.ucsf.edu
Jeffrey J. GrayJohns Hopkins University, Chemical and Biomolecular Engineering / Program in Molecular BiophysicsΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα jhu.edu
Matthew O'MearaUniversity of MichiganΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα umich.edu
Oliver F LangeGoogle IncΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα google.com
Gaetano T Montelione, Constellation...Rensselaer Polytechnic InstituteΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα rpi.edu
Ekaterina MichonovaErskine CollegeΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα erskine.edu

Παρακολούθηση

Yifan Song

Cyrus Biotechnology

Η διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα cyrusbio.com - Αρχική σελίδα

In silico protein modeling and design


Τίτλος Ταξινόμηση με βάση τις αναφορές Ταξινόμηση κατά έτος Ταξινόμηση κατά τίτλο	Παρατίθεται από Παρατίθεται από	Έτος
High-resolution comparative modeling with RosettaCM Y Song, F DiMaio, RYR Wang, D Kim, C Miles, TJ Brunette, J Thompson, ... Structure 21 (10), 1735-1742, 2013	1217	2013
Macromolecular modeling and design in Rosetta: recent methods and frameworks JK Leman, BD Weitzner, SM Lewis, J Adolf-Bryfogle, N Alam, RF Alford, ... Nature methods 17 (7), 665-680, 2020	732	2020
Optimization of affinity, specificity and function of designed influenza inhibitors using deep sequencing TA Whitehead, A Chevalier, Y Song, C Dreyfus, SJ Fleishman, ... Nature biotechnology 30 (6), 543-548, 2012	462	2012
Automated structure refinement of macromolecular assemblies from cryo-EM maps using Rosetta RYR Wang, Y Song, BA Barad, Y Cheng, JS Fraser, F DiMaio Elife 5, e17219, 2016	455	2016
Accurate de novo design of hyperstable constrained peptides G Bhardwaj, VK Mulligan, CD Bahl, JM Gilmore, PJ Harvey, O Cheneval, ... Nature 538 (7625), 329-335, 2016	444	2016
Alternate states of proteins revealed by detailed energy landscape mapping MD Tyka, DA Keedy, I André, F DiMaio, Y Song, DC Richardson, ... Journal of molecular biology 405 (2), 607-618, 2011	382	2011
Atomic-accuracy models from 4.5-Å cryo-electron microscopy data with density-guided iterative local refinement F DiMaio, Y Song, X Li, MJ Brunner, C Xu, V Conticello, E Egelman, ... Nature methods 12 (4), 361-365, 2015	344	2015
MCCE2: Improving protein pK_a calculations with extensive side chain rotamer sampling Y Song, J Mao, MR Gunner Journal of computational chemistry 30 (14), 2231-2247, 2009	272	2009
Computational redesign of a mononuclear zinc metalloenzyme for organophosphate hydrolysis SD Khare, Y Kipnis, PJ Greisen, R Takeuchi, Y Ashani, M Goldsmith, ... Nature chemical biology 8 (3), 294-300, 2012	257	2012
Scientific benchmarks for guiding macromolecular energy function improvement A Leaver-Fay, MJ O'meara, M Tyka, R Jacak, Y Song, EH Kellogg, ... Methods in enzymology 523, 109-143, 2013	252	2013
Determination of solution structures of proteins up to 40 kDa using CS-Rosetta with sparse NMR data from deuterated samples OF Lange, P Rossi, NG Sgourakis, Y Song, HW Lee, JM Aramini, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 109 (27), 10873-10878, 2012	231	2012
A computationally designed inhibitor of an Epstein-Barr viral Bcl-2 protein induces apoptosis in infected cells E Procko, GY Berguig, BW Shen, Y Song, S Frayo, AJ Convertine, ... Cell 157 (7), 1644-1656, 2014	154	2014
One contact for every twelve residues allows robust and accurate topology‐level protein structure modeling DE Kim, F DiMaio, R Yu‐Ruei Wang, Y Song, D Baker Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 82, 208-218, 2014	118	2014
Factors influencing the energetics of electron and proton transfers in proteins. What can be learned from calculations MR Gunner, J Mao, Y Song, J Kim Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Bioenergetics 1757 (8), 942-968, 2006	113	2006
Prediction of protein mutational free energy: benchmark and sampling improvements increase classification accuracy B Frenz, SM Lewis, I King, F DiMaio, H Park, Y Song Frontiers in bioengineering and biotechnology 8, 558247, 2020	90	2020
Calculated Proton Uptake on Anaerobic Reduction of Cytochrome c Oxidase: Is the Reaction Electroneutral? Y Song, E Michonova-Alexova, MR Gunner Biochemistry 45 (26), 7959-7975, 2006	88	2006
Calculation of proton transfers in bacteriorhodopsin bR and M intermediates Y Song, J Mao, MR Gunner Biochemistry 42 (33), 9875-9888, 2003	83	2003
Structure‐guided forcefield optimization Y Song, M Tyka, A Leaver‐Fay, J Thompson, D Baker Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 79 (6), 1898-1909, 2011	66	2011
Using multiconformation continuum electrostatics to compare chloride binding motifs in α-amylase, human serum albumin, and Omp32 Y Song, MR Gunner Journal of molecular biology 387 (4), 840-856, 2009	53	2009
Trapping a transition state in a computationally designed protein bottle AD Pearson, JH Mills, Y Song, F Nasertorabi, GW Han, D Baker, ... Science 347 (6224), 863-867, 2015	46	2015

Δεν είναι δυνατή η εκτέλεση της ενέργειας από το σύστημα αυτή τη στιγμή. Προσπαθήστε ξανά αργότερα.

Άρθρα 1–20

Παραθέσεις ανά έτος

Διπλότυπες αναφορές

Συγχωνευμένες αναφορές

Προσθήκη από κοινού συγγραφέωνΣυν-συγγραφείς

Παρακολούθηση

Παρατίθεται από

Συν-συγγραφείς