Daniel A. Keedy

Παρατίθεται από

	Όλα	Από το 2020
Παραθέσεις	20669	10645
h-index	22	17
i10-index	26	23

2200

1100

550

1650

2010201120122013201420152016201720182019202020212022202320242025105 412 636 887 1006 1103 1195 1342 1431 1803 1944 1998 2143 2087 2179 294

Δημόσια πρόσβαση

Προβολή όλων

35 άρθρα

1 άρθρο

διαθέσιμα

μη διαθέσιμα

Σύμφωνα με εντολές χρηματοδότησης

Συν-συγγραφείς

Jane S. RichardsonProfessor of Biochemistry, Duke UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα duke.edu
David C. RichardsonProfessor of Biochemistry, Duke UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα kinemage.biochem.duke.edu
Jeff HeaddJohnson & Johnson Innovative MedicineΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα its.jnj.com
James S. FraserProfessor, University of California San FranciscoΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα ucsf.edu
Henry van den BedemSVP ML Research & Cheminformatics, Atomwise Inc. and Dept of BTS, UCSFΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα ucsf.edu
Bradley HintzeDuke UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα hintze.org
Paul D. AdamsLawrence Berkeley Laboratory & University of California BerkeleyΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα lbl.gov
Bruce DonaldProfessor of Computer Science, Mathematics, Chemistry, and Biochemistry, Duke UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα cs.duke.edu
James A. WellsUniversity of California, San FranciscoΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα ucsf.edu
T. Justin RettenmaierJnana TherapeuticsΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα jnanatx.com
Ivelin GeorgievVanderbiltΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα vumc.org
Rahel A. WoldeyesPostdoctoral Research Fellow - Stanford UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα stanford.edu
Lillian KennerΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα gene.com
David A. SivakProfessor and Canada Research Chair, Dept. of Physics, Simon Fraser UΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα sfu.ca
Matt Warkentinphysics, cornell universityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα cornell.edu
Robert E. ThorneProfessor of Physics, Cornell UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα cornell.edu
David BakerUniversity of WashingtonΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα uw.edu
Yifan SongCyrus BiotechnologyΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα cyrusbio.com
Nicholas M PearceAssistant Professor, Linköping UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα liu.se
Mark HallenDuke UniversityΗ διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα duke.edu

Παρακολούθηση

Daniel A. Keedy

CUNY Advanced Science Research Center

Η διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου έχει επαληθευτεί στον τομέα gc.cuny.edu - Αρχική σελίδα

structural biology allostery protein design


Τίτλος Ταξινόμηση με βάση τις αναφορές Ταξινόμηση κατά έτος Ταξινόμηση κατά τίτλο	Παρατίθεται από Παρατίθεται από	Έτος
MolProbity: all-atom structure validation for macromolecular crystallography VB Chen, WB Arendall, JJ Headd, DA Keedy, RM Immormino, GJ Kapral, ... Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography 66 (1), 12-21, 2010	14800	2010
MolProbity: more and better reference data for improved all‐atom structure validation CJ Williams, JJ Headd, NW Moriarty, MG Prisant, LL Videau, LN Deis, ... Protein Science 27 (1), 293-315, 2018	3597	2018
Alternate states of proteins revealed by detailed energy landscape mapping MD Tyka, DA Keedy, I André, F DiMaio, Y Song, DC Richardson, ... Journal of molecular biology 405 (2), 607-618, 2011	378	2011
CryptoSite: expanding the druggable proteome by characterization and prediction of cryptic binding sites P Cimermancic, P Weinkam, TJ Rettenmaier, L Bichmann, DA Keedy, ... Journal of molecular biology 428 (4), 709-719, 2016	223	2016
Mapping the conformational landscape of a dynamic enzyme by multitemperature and XFEL crystallography DA Keedy, LR Kenner, M Warkentin, RA Woldeyes, JB Hopkins, ... Elife 4, e07574, 2015	190	2015
An expanded allosteric network in PTP1B by multitemperature crystallography, fragment screening, and covalent tethering DA Keedy, ZB Hill, JT Biel, E Kang, TJ Rettenmaier, J Brandao-Neto, ... Elife 7, e36307, 2018	160	2018
Crystal cryocooling distorts conformational heterogeneity in a model Michaelis complex of DHFR DA Keedy, H Van Den Bedem, DA Sivak, GA Petsko, D Ringe, MA Wilson, ... Structure 22 (6), 899-910, 2014	149	2014
osprey: Protein Design with Ensembles, Flexibility, and Provable Algorithms. P Gainza, KE Roberts, I Georgiev, RH Lilien, DA Keedy, CY Chen, F Reza, ... Methods in enzymology 523, 87, 2013	143	2013
Dead‐End elimination with perturbations (“DEEPer”): A provable protein design algorithm with continuous sidechain and backbone flexibility MA Hallen, DA Keedy, BR Donald Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2012	107	2012
Algorithm for backrub motions in protein design I Georgiev, D Keedy, JS Richardson, DC Richardson, BR Donald Bioinformatics 24 (13), i196-i204, 2008	101	2008
Ultrasonic characterization of human cancellous bone in vitro using three different apparent backscatter parameters in the frequency range 0.6-15.0 MHz BK Hoffmeister, DP Johnson, JA Janeski, DA Keedy, BW Steinert, ... IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control 55 …, 2008	99	2008
The other 90% of the protein: Assessment beyond the Cαs for CASP8 template‐based and high‐accuracy models DA Keedy, CJ Williams, JJ Headd, WB Arendall III, VB Chen, GJ Kapral, ... Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 77 (S9), 29-49, 2009	96	2009
Exposing hidden alternative backbone conformations in X-ray crystallography using qFit DA Keedy, JS Fraser, H van den Bedem PLoS computational biology 11 (10), e1004507, 2015	92	2015
W., Richardson, JS, and Richardson, DC (2010)." MolProbity: all-atom structure validation for macromolecular crystallography VB Chen, WB Arendall III, JJ Headd, DA Keedy, RM Immormino, ... Acta Cryst. D 66, 12-21, 0	73
Conformational variation of proteins at room temperature is not dominated by radiation damage S Russi, A González, LR Kenner, DA Keedy, JS Fraser, H Bedem Journal of synchrotron radiation 24 (1), 73-82, 2017	63	2017
qFit-ligand Reveals Widespread Conformational Heterogeneity of Drug-Like Molecules in X-Ray Electron Density Maps GCP van Zundert, BM Hudson, SHP de Oliveira, DA Keedy, R Fonseca, ... Journal of Medicinal Chemistry 61 (24), 11183-11198, 2018	55	2018
Autofix for backward-fit sidechains: using MolProbity and real-space refinement to put misfits in their place JJ Headd, RM Immormino, DA Keedy, P Emsley, DC Richardson, ... Journal of structural and functional genomics 10, 83-93, 2009	47	2009
qFit 3: Protein and ligand multiconformer modeling for X‐ray crystallographic and single‐particle cryo‐EM density maps BT Riley, SA Wankowicz, SHP de Oliveira, GCP van Zundert, DW Hogan, ... Protein Science 30 (1), 270-285, 2021	45	2021
Room-temperature crystallography reveals altered binding of small-molecule fragments to PTP1B TS Mehlman, JT Biel, SM Azeem, ER Nelson, S Hossain, L Dunnett, ... Elife 12, e84632, 2023	44	2023
Journey to the center of the protein: allostery from multitemperature multiconformer X-ray crystallography DA Keedy Acta Crystallographica Section D: Structural Biology 75 (2), 123-137, 2019	36	2019

Δεν είναι δυνατή η εκτέλεση της ενέργειας από το σύστημα αυτή τη στιγμή. Προσπαθήστε ξανά αργότερα.

Άρθρα 1–20

Παραθέσεις ανά έτος

Διπλότυπες αναφορές

Συγχωνευμένες αναφορές

Προσθήκη από κοινού συγγραφέωνΣυν-συγγραφείς

Παρακολούθηση

Παρατίθεται από

Συν-συγγραφείς