| PBM-PAI di Sekolah: Eksistensi dan Proses Belajar Mengajar Pendidikan Agama Islam C Thoha, A Mu’ti Yogyakarta: Pustaka Pelajar 183, 1998 | 208 | 1998 |
| The limits of religious freedom in Indonesia: with reference to the first pillar Ketuhanan Yang Maha Esa of Pancasila A Mu'ti, AN Burhani Indonesian Journal of Islam and Muslim Societies 9 (1), 111-134, 2019 | 76 | 2019 |
| Kristen Muhammadiyah: konvergensi Muslim dan Kristen dalam pendidikan A Mu'ti, FRU Haq Al-Wasat Publishing House, 2009 | 58 | 2009 |
| Kosmopolitanisme Islam Berkemajuan: Catatan Kritis Muktamar Teladan Ke-47 Muhammadiyah di Makasar 2015 A Mu'ti, FR Ulhaq, A Khoirudin, AF Fanani Muhammadiyah University Press, 2016 | 50 | 2016 |
| Systematic review tentang pengaruh obesitas terhadap kejadian komplikasi diabetes melitus tipe dua CC Regina, A Mu'ti, E Fitriany Verdure: Health Science Journal 3 (1), 8-17, 2021 | 37 | 2021 |
| Akar pluralisme dalam pendidikan Muhammadiyah A Mu’ti Afkaruna: Indonesian Interdisciplinary Journal of Islamic Studies 12 (1), 1-42, 2016 | 34 | 2016 |
| Proses belajar mengajar PBM-PAI di sekolah C Thoha, A Mu’thi Yogyakarta: Pustaka Pelajar, 1998 | 34 | 1998 |
| Toleransi yang otentik: menghadirkan nilai kemanusiaan dan keterbukaan dalam beragama, berpolitik dan peradaban global A Mu'ti Al Wasat Publishing House, 2019 | 31 | 2019 |
| Pluralisme positif: konsep dan implementasi dalam pendidikan Muhammadiyah A Mu'ti, A Khoirudin Majelis Pustaka dan Informasi PP Muhammadiyah, 2019 | 26 | 2019 |
| Pluralistic Islamic religious education: A vision for Indonesia A Mu’ti The Review of Faith & International Affairs 21 (2), 121-127, 2023 | 23 | 2023 |
| Kekerasan Seksual di Lingkungan Pesantren DC Aprilia, A Mu'ti, S Sururin Journal on Education 5 (1), 662-675, 2022 | 21 | 2022 |
| PBM PAI di Sekolah C Thaha, A Mu’ti Eksistensi dan Proses Belajar Mengajar Pendidikan Agama Islam,(Yogyakarta …, 1998 | 19 | 1998 |
| PBM-PAI Di Sekolah; Eksistensi Dan Proses Belajar Mengajar Pendidikan Agama Islam T Chabib, A Mu’ti Pustaka Pelajar, 1998 | 16 | 1998 |
| Ta’awun untuk negeri: Transformasi Al-Ma’un dalam konteks keindonesiaan A Mu’ti, AJ Muis, A Khoirudin, BD Kurniawan, B Prakoso Jakarta: Majelis Pustaka dan Informasi PP Muhammadiyah, 2019 | 13 | 2019 |
| Gambaran Pengetahuan Ibu tentang ASI Eksklusif dan Cara Pemberian ASI Eksklusif pada Bayi Usia 0-6 bulan di Puskesmas Segiri Samarinda AP Pertiwi, A Mu’ti, M Buchori Jurnal Ked. Mulawarman 9 (3), 103-109, 2022 | 12 | 2022 |
| Ta’awun untuk Negeri: Konteks Keindonesiaan A Mu'ti Muhammadiyah University Press, 2019 | 10 | 2019 |
| Local Wisdom-Based Multicultural Education: Muhammadiyah Experience A Mu'ti Intellectual Discourse 33 (Special Issue 1), 2025 | 9 | 2025 |
| Beragama dan Pendidikan yang Mencerahkan: Perspektif Multidisiplin dalam Orientasi Harishun A Mu'ti, MAM Binfas Uhamka Press, 2019 | 8 | 2019 |
| Inkulturasi Islam: menyemai persaudaraan, keadilan, dan emansipasi kemanusiaan A Mu'ti Al-Wasat, 2009 | 8 | 2009 |
| Pendidikan Agama Islam yang Pluralistis: Basis Nilai dan Arah Pembaruan A Mu’ti Pidato Pengukuhan Guru Besar UIN Syarif Hidayatullah Jakarta, 2020 | 7 | 2020 |