Debora Marks

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Coautores

Chris SanderHarvard Medical School, Broad Institute, MGH, Dana-Farber Cancer Institute, Memorial Sloan KetteringDirección de correo verificada de sanderlab.org
Thomas A. HopfScientific ConsultantDirección de correo verificada de thomashopf.com
John IngrahamGenerate Biomedicines, IncDirección de correo verificada de csail.mit.edu
Anton EnrightProfessor of RNA Biology and Genomics, Pathology Dept., University of CambridgeDirección de correo verificada de cam.ac.uk
Anna G. GreenAssistant Professor, Manning College of Information and Computer Sciences, UMass, AmherstDirección de correo verificada de umass.edu
Charlotta ScharfePrincipal Data Scientist, F. Hoffmann-La Roche, SwitzerlandDirección de correo verificada de roche.com
Riccardo Zecchinaprofessor, theoretical physics, Bocconi UniversityDirección de correo verificada de unibocconi.it
Doron BetelAssistant Professor of Computational Biomedicine, Weill Cornell Medical CollegeDirección de correo verificada de med.cornell.edu
Christina LeslieMemorial Sloan Kettering Cancer CenterDirección de correo verificada de mskcc.org
Andrea PagnaniProfessor at DISAT - Politecnico di Torino, and PI at the IIGMDirección de correo verificada de polito.it
James J. RussoResearch Scientist, Associate DirectorDirección de correo verificada de columbia.edu
Martin WeigtSorbonne Université Paris (former Université Pierre & Marie Curie)Dirección de correo verificada de upmc.fr
Bryan J. LuntPhD Candidate, University of Illinois as Urbana-ChampaignDirección de correo verificada de illinois.edu
Erik Larsson LekholmSahlgrenska Academy, University of GothenburgDirección de correo verificada de gu.se
Sébastien PfefferInstitut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, CNRSDirección de correo verificada de unistra.fr
Burkhard RostProfessor of Computer Science, Technical University MunichDirección de correo verificada de tum.de
Martin L MillerSenior Director, AstraZenecaDirección de correo verificada de astrazeneca.com
Anders Jacobsen SkanderupGenome Institute of SingaporeDirección de correo verificada de gis.a-star.edu.sg
Aaron ArveyArvey ConsultingDirección de correo verificada de ucsf.edu
Kenneth S. Kosik UC Santa BarbaraDirección de correo verificada de lifesci.ucsb.edu

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Debora Marks

Systems Biology, Harvard Medical School, Broad Institute of Harvard and MIT

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machine learning genomics drug design statistical inference protein folding & design


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
Human microRNA targets B John, AJ Enright, A Aravin, T Tuschl, C Sander, DS Marks PLoS biology 2 (11), e363, 2004	4597	2004
MicroRNA targets in Drosophila AJ Enright, B John, U Gaul, T Tuschl, C Sander, DS Marks Genome biology 5 (1), 1-1, 2003	4017	2003
The microRNA. org resource: targets and expression D Betel, M Wilson, A Gabow, DS Marks, C Sander Nucleic acids research 36 (suppl_1), D149-D153, 2008	3039	2008
Identification of virus-encoded microRNAs S Pfeffer, M Zavolan, FA Grässer, M Chien, JJ Russo, J Ju, B John, ... Science 304 (5671), 734-736, 2004	2135	2004
Direct-coupling analysis of residue coevolution captures native contacts across many protein families F Morcos, A Pagnani, B Lunt, A Bertolino, DS Marks, C Sander, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 108 (49), E1293-E1301, 2011	1592	2011
The small RNA profile during Drosophila melanogaster development AA Aravin, M Lagos-Quintana, A Yalcin, M Zavolan, D Marks, B Snyder, ... Developmental cell 5 (2), 337-350, 2003	1303	2003
Protein 3D structure computed from evolutionary sequence variation DS Marks, LJ Colwell, R Sheridan, TA Hopf, A Pagnani, R Zecchina, ... PloS one 6 (12), e28766, 2011	1284	2011
miR-122, a mammalian liver-specific microRNA, is processed from hcr mRNA and maydownregulate the high affinity cationic amino acid transporter CAT-1 J Chang, E Nicolas, D Marks, C Sander, A Lerro, MA Buendia, C Xu, ... RNA biology 1 (2), 106-113, 2004	1069	2004
Scientific discovery in the age of artificial intelligence H Wang, T Fu, Y Du, W Gao, K Huang, Z Liu, P Chandak, S Liu, ... Nature 620 (7972), 47-60, 2023	916	2023
Protein structure prediction from sequence variation DS Marks, TA Hopf, C Sander Nature biotechnology 30 (11), 1072-1080, 2012	725	2012
miRcode: a map of putative microRNA target sites in the long non-coding transcriptome A Jeggari, DS Marks, E Larsson Bioinformatics 28 (15), 2062-2063, 2012	713	2012
Mutation effects predicted from sequence co-variation TA Hopf, JB Ingraham, FJ Poelwijk, CPI Schärfe, M Springer, C Sander, ... Nature biotechnology 35 (2), 128-135, 2017	707	2017
Transfection of small RNAs globally perturbs gene regulation by endogenous microRNAs AA Khan, D Betel, ML Miller, C Sander, CS Leslie, DS Marks Nature biotechnology 27 (6), 549-555, 2009	673	2009
Deep generative models of genetic variation capture the effects of mutations AJ Riesselman, JB Ingraham, DS Marks Nature methods 15 (10), 816-822, 2018	626	2018
Three-dimensional structures of membrane proteins from genomic sequencing TA Hopf, LJ Colwell, R Sheridan, B Rost, C Sander, DS Marks Cell 149 (7), 1607-1621, 2012	601	2012
Disease variant prediction with deep generative models of evolutionary data J Frazer, P Notin, M Dias, A Gomez, JK Min, K Brock, Y Gal, DS Marks Nature 599 (7883), 91-95, 2021	577	2021
MicroRNA profiling of the murine hematopoietic system S Monticelli, KM Ansel, C Xiao, ND Socci, AM Krichevsky, TH Thai, ... Genome biology 6, 1-15, 2005	575	2005
Sequence co-evolution gives 3D contacts and structures of protein complexes TA Hopf, CPI Schärfe, JP Rodrigues, AG Green, O Kohlbacher, C Sander, ... elife 3, e03430, 2014	545	2014
MicroRNA control of protein expression noise JM Schmiedel, SL Klemm, Y Zheng, A Sahay, N Blüthgen, DS Marks, ... Science 348 (6230), 128-132, 2015	443	2015
The developmental miRNA profiles of zebrafish as determined by small RNA cloning PY Chen, H Manninga, K Slanchev, M Chien, JJ Russo, J Ju, R Sheridan, ... Genes & development 19 (11), 1288-1293, 2005	443	2005

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