Justin J.J. van der Hooft

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Marnix MedemaProfessor of Bioinformatics at Wageningen University & Leiden UniversityDirección de correo verificada de wur.nl
Simon RogersSenior Lecturer, Computing Science, University of GlasgowDirección de correo verificada de glasgow.ac.uk
Pieter C DorresteinUCSDDirección de correo verificada de ucsd.edu
De VosWageningenDirección de correo verificada de wur.nl
Jacques Vervoortprofessor analytical biochemistryDirección de correo verificada de wur.nl
Mingxun WangUC RiversideDirección de correo verificada de ucr.edu
Louis-Félix NothiasChaire de Professeur Junior CNRS - Université Cote d'AzurDirección de correo verificada de cnrs.fr
Joe WandyPrincipal Bioinformatics Developer, MetabolonDirección de correo verificada de metabolon.com
Madeleine ErnstSection for Clinical Mass Spectrometry, Danish Center for Neonatal ScreeningDirección de correo verificada de ssi.dk
Florian HuberProfessor for Data Science, HSD - Düsseldorf University of Applied SciencesDirección de correo verificada de hs-duesseldorf.de
Karl BurgessProfessor, University of EdinburghDirección de correo verificada de ed.ac.uk
Raoul John BinoWageningen University & ResearchDirección de correo verificada de wur.nl
Kyo Bin KangCollege of Pharmacy, Sookmyung Women's UniversityDirección de correo verificada de sookmyung.ac.kr
Ricardo Roberto da SilvaUniversity of São PauloDirección de correo verificada de usp.br
MP Barrettuniversity of GlasgowDirección de correo verificada de glasgow.ac.uk
Mauricio CaraballoUniversity of California San DiegoDirección de correo verificada de ucsd.edu
Rónán DalyHead of Biological Data Science, University of Glasgow, MVLS Shared Research FacilitiesDirección de correo verificada de glasgow.ac.uk
Satria A KautsarJoint Genome Institute / Berkeley LabDirección de correo verificada de lbl.gov
John van DuynhovenUnilever R&D Wageningen University Twente University Nijmegen UniversityDirección de correo verificada de unilever.com
Alan CrozierKing Saud University/University of GlasgowDirección de correo verificada de glasgow.ac.uk

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Justin J.J. van der Hooft

Assistant Professor Computational Metabolomics @ WUR

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Author Correction: Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 E Bolyen, JR Rideout, MR Dillon, NA Bokulich, CC Abnet, GA Al-Ghalith, ... Nature biotechnology 37 (9), 1091-1091, 2019	17427*	2019
Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 E Bolyen, JR Rideout, MR Dillon, NA Bokulich, CC Abnet, GA Al-Ghalith, ... Nature biotechnology 37 (8), 852-857, 2019	17377	2019
QIIME 2: Reproducible, interactive, scalable, and extensible microbiome data science E Bolyen, JR Rideout, MR Dillon, NA Bokulich, C Abnet, GA Al-Ghalith, ... PeerJ Preprints 6, e27295v2, 2018	1122	2018
Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment LF Nothias, D Petras, R Schmid, K Dührkop, J Rainer, A Sarvepalli, ... Nature Methods 17 (9), 905-908, 2020	1076	2020
MIBiG 2.0: a repository for biosynthetic gene clusters of known function SA Kautsar, K Blin, S Shaw, JC Navarro-Muñoz, BR Terlouw, ... Nucleic acids research 48 (D1), D454-D458, 2020	649	2020
Reproducible Molecular Networking Of Untargeted Mass Spectrometry Data Using GNPS. AT Aron, E Gentry, KL McPhail, LF Nothias, M Nothias-Esposito, ... ChemRxiv, 2019	540	2019
The food metabolome: a window over dietary exposure A Scalbert, L Brennan, C Manach, C Andres-Lacueva, LO Dragsted, ... American Journal of Clinical Nutrition, Online first, 2014	540	2014
The natural products atlas: an open access knowledge base for microbial natural products discovery JA Van Santen, G Jacob, AL Singh, V Aniebok, MJ Balunas, D Bunsko, ... ACS Central Science 5 (11), 1824-1833, 2019	367	2019
Topic modeling for untargeted substructure exploration in metabolomics JJJ van der Hooft, J Wandy, MP Barrett, KEV Burgess, S Rogers Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of …, 2016	365	2016
MolNetEnhancer: enhanced molecular networks by integrating metabolome mining and annotation tools M Ernst, KB Kang, AM Caraballo-Rodriguez, LF Nothias, J Wandy, ... Metabolites, 2019	355	2019
Propagating annotations of molecular networks using in silico fragmentation RR da Silva, M Wang, LF Nothias, JJJ van der Hooft, ... PLoS computational biology 14 (4), e1006089, 2018	343	2018
MIBiG 3.0: a community-driven effort to annotate experimentally validated biosynthetic gene clusters BR Terlouw, K Blin, JC Navarro-Muñoz, NE Avalon, MG Chevrette, ... Nucleic acids research 51 (D1), D603-D610, 2023	279	2023
NPClassifier: A deep neural network-based structural classification tool for natural products HW Kim, M Wang, CA Leber, LF Nothias, R Reher, KB Kang, ... Journal of Natural Products 84 (11), 2795-2807, 2021	267	2021
Human studies on the absorption, distribution, metabolism, and excretion of tea polyphenols MN Clifford, JJJ van der Hooft, A Crozier The American journal of clinical nutrition 98 (6), 1619S-1630S, 2013	266	2013
Accelerating metabolite identification in natural product research: toward an ideal combination of LC-HRMS/MS and NMR profiling, in silico databases and chemometrics JL Wolfender, JM Nuzillard, JJJ van der Hooft, JH Renault, S Bertrand Analytical Chemistry, 2018	258*	2018
Mass spectrometry searches using MASST M Wang, AK Jarmusch, F Vargas, AA Aksenov, JM Gauglitz, K Weldon, ... Nature biotechnology 38 (1), 23-26, 2020	220	2020
Absorption, metabolism, distribution and excretion of (−)-epicatechin: A review of recent findings G Borges, JI Ottaviani, JJJ van der Hooft, H Schroeter, A Crozier Molecular Aspects of Medicine, 2017	193	2017
Spec2Vec: Improved mass spectral similarity scoring through learning of structural relationships F Huber, L Ridder, S Verhoeven, JH Spaaks, F Diblen, S Rogers, ... PLOS Computational Biology 17 (2), e1008724, 2021	173	2021
Orange juice (poly) phenols are highly bioavailable in humans G Pereira-Caro, G Borges, J van der Hooft, MN Clifford, D Del Rio, ... The American Journal of Clinical Nutrition 100 (5), 1378-1384, 2014	172	2014
Linking genomics and metabolomics to chart specialized metabolic diversity JJJ van der Hooft, H Mohimani, A Bauermeister, PC Dorrestein, ... Chemical Society Reviews, 2020	167	2020

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