Gabriel Moreno-Hagelsieb

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Coautores

Julio Collado-VidesProfessor of Computational Genomics, CCG, UNAMDirección de correo verificada de ccg.unam.mx
Arturo Medrano-SotoUniversity of California, San DiegoDirección de correo verificada de ucsd.edu
Sarath Chandra JangaAssociate Professor of Informatics and Computing, Indiana University (IUPUI)Dirección de correo verificada de iupui.edu
Milton SaierProfessor of Molecular Biology, UC San DiegoDirección de correo verificada de ucsd.edu
Josh D. NeufeldDepartment of Biology, University of WaterlooDirección de correo verificada de uwaterloo.ca
Andrew D PatersonSenior Scientist, Hospital for Sick ChildrenDirección de correo verificada de sickkids.ca
Mark S. SilverbergMount Sinai Hospital, University of TorontoDirección de correo verificada de sinaihealth.ca
Michael DJ LynchMetagenom Bio Life Science and Department of Biology, University of WaterlooDirección de correo verificada de uwaterloo.ca
Jack GreenblattProfessor, University of TorontoDirección de correo verificada de utoronto.ca
Bernard R. GlickProfessor Emeritus, Department of Biology, University of Waterloo, CanadaDirección de correo verificada de uwaterloo.ca
Jennifer StearnsMcMaster UniversityDirección de correo verificada de mcmaster.ca
Sadhna PhanseSenior Analyst, University of Regina, Oregon Health and Science UniversityDirección de correo verificada de ohsu.edu
Vamsee ReddyMD (2021), Boston UniversityDirección de correo verificada de bu.edu
Andrea K BartramUniversity of WaterlooDirección de correo verificada de uwaterloo.ca
Luis D. AlcarazProfessor, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, UNAMDirección de correo verificada de ciencias.unam.mx
John ParkinsonSenior Scientist, Hospital for Sick ChildrenDirección de correo verificada de utoronto.ca
Roland ArnoldUniversity of BirminghamDirección de correo verificada de bham.ac.uk
Eric D BrownProfessor of Biochemistry, McMaster UniversityDirección de correo verificada de mcmaster.ca
Dennis CvitkovitchProfessor University of TorontoDirección de correo verificada de dentistry.utoronto.ca
Dilani B. SenadheeraAssistant Professor, University of TorontoDirección de correo verificada de utoronto.ca

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Gabriel Moreno-Hagelsieb

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Computational biology Genomics Metagenomics Comparative Genomics Functional interactions


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Plant growth-promoting bacterial endophytes G Santoyo, G Moreno-Hagelsieb, M del Carmen Orozco-Mosqueda, ... Microbiological research 183, 92-99, 2016	1811	2016
Generation of multimillion-sequence 16S rRNA gene libraries from complex microbial communities by assembling paired-end Illumina reads AK Bartram, MDJ Lynch, JC Stearns, G Moreno-Hagelsieb, JD Neufeld Applied and environmental microbiology 77 (11), 3846-3852, 2011	1004	2011
The transporter classification database (TCDB): recent advances MH Saier Jr, VS Reddy, BV Tsu, MS Ahmed, C Li, G Moreno-Hagelsieb Nucleic acids research 44 (D1), D372-D379, 2016	734	2016
Choosing BLAST options for better detection of orthologs as reciprocal best hits G Moreno-Hagelsieb, K Latimer Bioinformatics 24 (3), 319-324, 2008	570	2008
Operons in Escherichia coli: genomic analyses and predictions H Salgado, G Moreno-Hagelsieb, TF Smith, J Collado-Vides Proceedings of the National Academy of Sciences 97 (12), 6652-6657, 2000	494	2000
Association of host genome with intestinal microbial composition in a large healthy cohort W Turpin, O Espin-Garcia, W Xu, MS Silverberg, D Kevans, MI Smith, ... Nature genetics 48 (11), 1413-1417, 2016	490	2016
Bacterial biogeography of the human digestive tract JC Stearns, MDJ Lynch, DB Senadheera, HC Tenenbaum, MB Goldberg, ... Scientific reports 1 (1), 170, 2011	479	2011
Global functional atlas of Escherichia coli encompassing previously uncharacterized proteins P Hu, SC Janga, M Babu, JJ Díaz-Mejía, G Butland, W Yang, O Pogoutse, ... PLoS biology 7 (4), e1000096, 2009	452	2009
The partitioned Rhizobium etli genome: genetic and metabolic redundancy in seven interacting replicons V González, RI Santamaría, P Bustos, I Hernández-González, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 103 (10), 3834-3839, 2006	448	2006
The transporter classification database (TCDB): 2021 update MH Saier Jr, VS Reddy, G Moreno-Hagelsieb, KJ Hendargo, Y Zhang, ... Nucleic acids research 49 (D1), D461-D467, 2021	314	2021
eSGA: E. coli synthetic genetic array analysis G Butland, M Babu, JJ Díaz-Mejía, F Bohdana, S Phanse, B Gold, W Yang, ... Nature methods 5 (9), 789-795, 2008	311	2008
Evaluating bias of Illumina-based bacterial 16S rRNA gene profiles K Kennedy, MW Hall, MDJ Lynch, G Moreno-Hagelsieb, JD Neufeld Applied and environmental microbiology 80 (18), 5717-5722, 2014	291	2014
A powerful non-homology method for the prediction of operons in prokaryotes G Moreno-Hagelsieb, J Collado-Vides Bioinformatics 18 (suppl_1), S329-S336, 2002	260	2002
Understanding the evolutionary relationships and major traits of Bacillus through comparative genomics LD Alcaraz, G Moreno-Hagelsieb, LE Eguiarte, V Souza, ... BMC genomics 11, 1-17, 2010	258	2010
The mosaic structure of the symbiotic plasmid of Rhizobium etliCFN42 and its relation to other symbiotic genome compartments V González, P Bustos, MA Ramírez-Romero, A Medrano-Soto, H Salgado, ... Genome biology 4, 1-13, 2003	195	2003
Quickly finding orthologs as reciprocal best hits with BLAT, LAST, and UBLAST: how much do we miss? N Ward, G Moreno-Hagelsieb PloS one 9 (7), e101850, 2014	187	2014
A comparative genomics approach to prediction of new members of regulons K Tan, G Moreno-Hagelsieb, J Collado-Vides, GD Stormo Genome research 11 (4), 566-584, 2001	158	2001
Whole-genome expression profiling defines the HrpL regulon of Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000, allows de novo reconstruction of the Hrp cis element, and identifies novel … AO Ferreira, CR Myers, JS Gordon, GB Martin, M Vencato, A Collmer, ... Molecular Plant-Microbe Interactions 19 (11), 1167-1179, 2006	140	2006
Genetic Interaction Maps in Escherichia coli Reveal Functional Crosstalk among Cell Envelope Biogenesis Pathways M Babu, JJ Díaz-Mejía, J Vlasblom, A Gagarinova, S Phanse, C Graham, ... PLoS genetics 7 (11), e1002377, 2011	138	2011
Quantitative Genome-Wide Genetic Interaction Screens Reveal Global Epistatic Relationships of Protein Complexes in Escherichia coli M Babu, R Arnold, C Bundalovic-Torma, A Gagarinova, KS Wong, ... PLoS genetics 10 (2), e1004120, 2014	134	2014

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