Eszter Ari

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Balint KintsesHCEMM - BRCDirección de correo verificada de brc.hu
Balázs PappBiological Research Centre & HCEMM, Szeged, HungaryDirección de correo verificada de brc.hu
Tamas KorcsmarosImperial College LondonDirección de correo verificada de imperial.ac.uk
Csaba PalBiological Research Center, HungaryDirección de correo verificada de brc.hu
Bálint Márk VásárhelyiSZBK; KREDirección de correo verificada de brc.hu
Orsolya Méhiresearch scientist, Biological Research Centre, Szeged, HungaryDirección de correo verificada de brc.hu
Gergely FeketeBRC Szeged, HungaryDirección de correo verificada de brc.hu
Bálint CsörgőHUN-REN Biological Research CentreDirección de correo verificada de embl.de
Pramod K. JangirBiozentrum, Switzerland| Department of Biology, University of OxfordDirección de correo verificada de unibas.ch
Dávid FazekasDepartment of Genetics, Eötvös Loránd UniversityDirección de correo verificada de netbiol.elte.hu
Akos NyergesDepartment of Genetics | Harvard Medical School | Email: akos_nyerges [at] hms.harvard.eduDirección de correo verificada de hms.harvard.edu
Dr Balazs BalintInstitute of Biochemistry, Biological Research CentreDirección de correo verificada de brc.hu
Peter CsermelySemmelweis University, professor of biochemistry and network scienceDirección de correo verificada de med.semmelweis-univ.hu
Ádám GyörkeiUiODirección de correo verificada de brc.hu
Janos PodaniProfessor, Eotvos UniversityDirección de correo verificada de ludens.elte.hu
Roland TengölicsBiological Research Centre (BRC), Hungarian Academy of Sciences, SzegedDirección de correo verificada de brc.hu
Padhmanand SudhakarKumaraguru College of TechnologyDirección de correo verificada de kct.ac.in
Krisztina Takács-VellaiDepartment of Biological Anthropology, Institute of Biology, Eötvös Loránd UniversityDirección de correo verificada de caesar.elte.hu
Klaudia FarkasUniversity of SzegedDirección de correo verificada de med.u-szeged.hu
Péter BacsurAlbert Szent-Györgyi Medical School, University of SzegedDirección de correo verificada de med.u-szeged.hu

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Eszter Ari

Biological Research Centre, Szeged; Eötvös L. Univ., Budapest

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Bioinformatics Molecular evolution Genomics Phylogenetics


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Directed evolution of multiple genomic loci allows the prediction of antibiotic resistance Á Nyerges, B Csörgő, G Draskovits, B Kintses, P Szili, G Ferenc, T Révész, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 115 (25), E5726-E5735, 2018	105	2018
Phylogenetic barriers to horizontal transfer of antimicrobial peptide resistance genes in the human gut microbiota B Kintses, O Méhi, E Ari, M Számel, Á Györkei, PK Jangir, I Nagy, F Pál, ... Nature microbiology 4 (3), 447-458, 2019	87	2019
TFLink: an integrated gateway to access transcription factor–target gene interactions for multiple species O Liska, B Bohár, A Hidas, T Korcsmáros, B Papp, D Fazekas, E Ari Database 2022, baac083, 2022	71	2022
Pantocsekiella, a new centric diatom genus based on morphological and genetic studies KKT Acs E, Ari E, Duleba M, Dressler M, Genkal SI, Jako E, Rimet F, Ector L Fottea 16 (1), 56-78, 2016	66*	2016
Targeted interplay between bacterial pathogens and host autophagy P Sudhakar, AC Jacomin, I Hautefort, S Samavedam, K Fatemian, E Ari, ... Autophagy 15 (9), 1620-1633, 2019	49	2019
Chemical-genetic profiling reveals limited cross-resistance between antimicrobial peptides with different modes of action B Kintses, PK Jangir, G Fekete, M Számel, O Méhi, R Spohn, L Daruka, ... Nature Communications 10 (1), 5731, 2019	44	2019
SignaLink3: a multi-layered resource to uncover tissue-specific signaling networks L Csabai, D Fazekas, T Kadlecsik, M Szalay-Bekő, B Bohár, M Madgwick, ... Nucleic acids research 50 (D1), D701-D709, 2022	34	2022
SalmoNet, an integrated network of ten Salmonella enterica strains reveals common and distinct pathways to host adaptation A Métris, P Sudhakar, D Fazekas, A Demeter, E Ari, M Olbei, P Branchu, ... NPJ systems biology and applications 3 (1), 31, 2017	32	2017
BOOL-AN: A method for comparative sequence analysis and phylogenetic reconstruction É Jakó, E Ari, P Ittzés, A Horváth, J Podani Molecular Phylogenetics and Evolution 52 (3), 887-897, 2009	31	2009
The C. elegans Hox gene ceh-13 regulates cell migration and fusion in a non-colinear way. Implications for the early evolution of Hoxclusters B Tihanyi, T Vellai, Á Regős, E Ari, F Müller, K Takács-Vellai BMC developmental biology 10, 1-14, 2010	30	2010
Functional anatomical changes in ulcerative colitis patients determine their gut microbiota composition and consequently the possible treatment outcome A Bálint, K Farkas, O Méhi, B Kintses, BM Vásárhelyi, E Ari, C Pál, ... Pharmaceuticals 13 (11), 346, 2020	25	2020
Methods to study autophagy in zebrafish E Fodor, T Sigmond, E Ari, K Lengyel, K Takacs-Vellai, M Varga, T Vellai Methods in enzymology 588, 467-496, 2017	25	2017
Starvation-response may not involve Atg1-dependent autophagy induction in non-unikont parasites L Földvári-Nagy, E Ari, P Csermely, T Korcsmáros, T Vellai Scientific Reports 4 (1), 5829, 2014	20	2014
Downregulation of transposable elements extends lifespan in Caenorhabditis elegans Á Sturm, É Saskői, B Hotzi, A Tarnóci, J Barna, F Bodnár, H Sharma, ... Nature communications 14 (1), 5278, 2023	19	2023
Interdisciplinary analyses of Bronze Age communities from Western Hungary reveal complex population histories D Gerber, B Szeifert, O Székely, B Egyed, B Gyuris, JI Giblin, A Horváth, ... Molecular Biology and Evolution 40 (9), msad182, 2023	18	2023
Discovering cooperative biomarkers for heterogeneous complex disease diagnoses D Sun, X Ren, E Ari, T Korcsmaros, P Csermely, LY Wu Briefings in bioinformatics 20 (1), 89-101, 2019	17	2019
Identification of critical paralog groups with indispensable roles in the regulation of signaling flow D Modos, J Brooks, D Fazekas, E Ari, T Vellai, P Csermely, T Korcsmaros, ... Scientific reports 6 (1), 38588, 2016	10	2016
A single early introduction governed viral diversity in the second wave of SARS-CoV-2 epidemic in Hungary E Ari, BM Vásárhelyi, G Kemenesi, GE Tóth, B Zana, B Somogyi, ... Virus Evolution 8 (2), veac069, 2022	8	2022
Comparison of Boolean analysis and standard phylogenetic methods using artificially evolved and natural mt-tRNA sequences from great apes E Ari, P Ittzés, J Podani, QC Le Thi, É Jakó Molecular phylogenetics and evolution 63 (1), 193-202, 2012	8	2012
Genomic surveillance as a scalable framework for precision phage therapy against antibiotic-resistant pathogens M Koncz, T Stirling, HH Mehdi, O Méhi, B Eszenyi, A Asbóth, G Apjok, ... Cell 187 (21), 5901-5918. e28, 2024	5	2024

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