Gergely J, Szöllősi

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Vincent DaubincnrsDirección de correo verificada de univ-lyon1.fr
Bastien BoussauLBBE, UMR 5558, CNRS researcher, Université de LyonDirección de correo verificada de univ-lyon1.fr
Tom A. WilliamsAssociate Professor in Molecular Evolution, University of BristolDirección de correo verificada de bristol.ac.uk
Eric TannierInria, IXXI, ENS Lyon, Univ LyonDirección de correo verificada de inria.fr
Adrián A. DavínPostdoctoral fellow at ETH ZürichDirección de correo verificada de ethz.ch
Imre DerenyiDepartment of Biological Physics, Eotvos University, HungaryDirección de correo verificada de elte.hu
Anja SpangResearch Leader at Royal Netherlands Institute for Sea Research (NIOZ), MMBDirección de correo verificada de nioz.nl
Dominik SchrempfDept. Biological Physics, Eötvös Loránd University, Budapest, HungaryDirección de correo verificada de caesar.elte.hu
Lénárd L. SzánthóOkinawa Institute of Science and Technology, OISTDirección de correo verificada de oist.jp
Celine ScornavaccaInstitut des Sciences de l'Evolution, MontpellierDirección de correo verificada de umontpellier.fr
Peter G. FosterNatural History Museum, LondonDirección de correo verificada de nhm.ac.uk
Martin EmbleyProfessor of Molecular Evolution, Newcastle UniversityDirección de correo verificada de ncl.ac.uk
Manolo GouyLaboratory of Biometry and Evolutionary Biology, CNRS, LyonDirección de correo verificada de univ-lyon1.fr
Benoit MorelHeidelberg Institute of Theoretical StudiesDirección de correo verificada de h-its.org
Alexandros StamatakisFoundation for Research and Technology - Hellas, HITS gGmbH, KITDirección de correo verificada de ics.forth.gr
Philip C. J. DonoghueProfessor of Palaeobiology, University of Bristol, School of Earth SciencesDirección de correo verificada de bristol.ac.uk
Philip HugenholtzAustralian Centre for Ecogenomics, SCMB, The University of QueenslandDirección de correo verificada de uq.edu.au
Tara A. MahendrarajahRoyal Netherlands Institute for Sea ResearchDirección de correo verificada de nioz.nl
Edmund R. R. MoodyUniversity of BristolDirección de correo verificada de bristol.ac.uk
James W. ClarkUniversity of BathDirección de correo verificada de bath.ac.uk

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Phase transition in the collective migration of tissue cells: experiment and model B Szabo, GJ Szöllösi, B Gönci, Z Jurányi, D Selmeczi, T Vicsek Physical Review E—Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 74 (6 …, 2006	605	2006
Damage and fluctuations induce loops in optimal transport networks E Katifori, GJ Szöllősi, MO Magnasco Physical review letters 104 (4), 048704, 2010	410	2010
Large-scale genome sequencing of mycorrhizal fungi provides insights into the early evolution of symbiotic traits S Miyauchi, E Kiss, A Kuo, E Drula, A Kohler, M Sánchez-García, E Morin, ... Nature communications 11 (1), 5125, 2020	357	2020
Genome-scale coestimation of species and gene trees B Boussau, GJ Szöllősi, L Duret, M Gouy, E Tannier, V Daubin Genome research 23 (2), 323-330, 2013	312	2013
The inference of gene trees with species trees GJ Szöllősi, E Tannier, V Daubin, B Boussau Systematic biology 64 (1), e42-e62, 2015	287	2015
Megaphylogeny resolves global patterns of mushroom evolution T Varga, K Krizsán, C Földi, B Dima, M Sánchez-García, ... Nature ecology & evolution 3 (4), 668-678, 2019	269	2019
Integrative modeling of gene and genome evolution roots the archaeal tree of life TA Williams, GJ Szöllősi, A Spang, PG Foster, SE Heaps, B Boussau, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 114 (23), E4602-E4611, 2017	249	2017
Phylogenomics provides robust support for a two-domains tree of life TA Williams, CJ Cox, PG Foster, GJ Szöllősi, TM Embley Nature ecology & evolution 4 (1), 138-147, 2020	231	2020
Efficient exploration of the space of reconciled gene trees GJ Szöllősi, W Rosikiewicz, B Boussau, E Tannier, V Daubin Systematic biology 62 (6), 901-912, 2013	218	2013
A rooted phylogeny resolves early bacterial evolution GA Coleman, AA Davín, TA Mahendrarajah, LL Szánthó, A Spang, ... Science 372 (6542), eabe0511, 2021	206	2021
Phylogenetic modeling of lateral gene transfer reconstructs the pattern and relative timing of speciations GJ Szöllősi, B Boussau, SS Abby, E Tannier, V Daubin Proceedings of the national academy of sciences 109 (43), 17513-17518, 2012	197	2012
An efficient algorithm for gene/species trees parsimonious reconciliation with losses, duplications and transfers JP Doyon, C Scornavacca, KY Gorbunov, GJ Szöllősi, V Ranwez, V Berry Comparative Genomics: International Workshop, RECOMB-CG 2010, Ottawa, Canada …, 2010	196	2010
Horizontal gene transfer and the history of life V Daubin, GJ Szöllősi Cold Spring Harbor perspectives in biology 8 (4), a018036, 2016	157	2016
Lateral gene transfer from the dead GJ Szöllősi, E Tannier, N Lartillot, V Daubin Systematic biology 62 (3), 386-397, 2013	138	2013
Emergent neutrality in adaptive asexual evolution S Schiffels, GJ Szöllősi, V Mustonen, M Lässig Genetics 189 (4), 1361-1375, 2011	130	2011
GeneRax: a tool for species-tree-aware maximum likelihood-based gene family tree inference under gene duplication, transfer, and loss B Morel, AM Kozlov, A Stamatakis, GJ Szöllősi Molecular biology and evolution 37 (9), 2763-2774, 2020	127	2020
Divergent evolutionary trajectories of bryophytes and tracheophytes from a complex common ancestor of land plants BJ Harris, JW Clark, D Schrempf, GJ Szöllősi, PCJ Donoghue, ... Nature Ecology & Evolution 6 (11), 1634-1643, 2022	117	2022
ecceTERA: comprehensive gene tree-species tree reconciliation using parsimony E Jacox, C Chauve, GJ Szöllősi, Y Ponty, C Scornavacca Bioinformatics 32 (13), 2056-2058, 2016	113	2016
How Long Does Wolbachia Remain on Board? M Bailly-Bechet, P Martins-Simões, GJ Szöllősi, G Mialdea, MF Sagot, ... Molecular Biology and Evolution 34 (5), 1183-1193, 2017	105	2017
Genome-scale phylogenetic analysis finds extensive gene transfer among fungi GJ Szöllősi, AA Davín, E Tannier, V Daubin, B Boussau Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 370 …, 2015	102	2015

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