Nathan Ahlgren

Viittaukset

	Kaikki	2020 lähtien
Sitaatit	4641	2541
h-indeksi	22	20
i10-indeksi	25	24

600

300

150

450

2003200420052006200720082009201020112012201320142015201620172018201920202021202220232024202526 69 104 121 117 119 89 125 87 126 103 143 103 158 139 180 263 302 523 532 497 591 94

Yleisessä käytössä

Näytä kaikki

19 artikkelia

0 artikkelia

käytettävissä

ei käytettävissä

Perustuu rahoitusehtoihin

Muut kirjoittajat

Jed A. FuhrmanMcCulloch Crosby Chair of Marine Biology, University of Southern CaliforniaVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa usc.edu
Gabrielle RocapSchool of Oceanography, University of WashingtonVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa uw.edu
Jie RenResearch Scientist at Google BrainVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa google.com
Fengzhu SunUniversity of Southern CaliforniaVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa usc.edu
Sallie W ChisholmInstitute Professor, Massachusetts Institute of TechnologyVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa mit.edu
Eric WebbUSCVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa usc.edu
Matthew B SullivanDistinguished Professor, Ohio State University / Founding Director, Center of Microbiome ScienceVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa osu.edu
Erik ZinserAssociate Professor, U. TennesseeVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa utk.edu
Anne W. ThompsonAsssistant Professor, Portland State UniversityVahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa pdx.edu

Seuraa

Nathan Ahlgren

Associate professor, Clark University

Vahvistettu sähköpostiosoite verkkotunnuksessa clarku.edu - Kotisivu

Viral ecology Marine microbial ecology Microbial genomics Computational biology


Nimike Lajittele sitaattien mukaan Lajittele vuoden mukaan Lajittele otsikon mukaan	Viittaukset Viittaukset	Vuosi
Genome divergence in two Prochlorococcus ecotypes reflects oceanic niche differentiation G Rocap, FW Larimer, J Lamerdin, S Malfatti, P Chain, NA Ahlgren, ... Nature 424 (6952), 1042-1047, 2003	1303	2003
VirFinder: a novel k-mer based tool for identifying viral sequences from assembled metagenomic data J Ren, NA Ahlgren, YY Lu, JA Fuhrman, F Sun Microbiome 5, 1-20, 2017	592	2017
Identifying viruses from metagenomic data using deep learning J Ren, K Song, C Deng, NA Ahlgren, JA Fuhrman, Y Li, X Xie, R Poplin, ... Quantitative Biology 8 (1), 64-77, 2020	479	2020
Alignment-free oligonucleotide frequency dissimilarity measure improves prediction of hosts from metagenomically-derived viral sequences NA Ahlgren, J Ren, YY Lu, JA Fuhrman, F Sun Nucleic acids research 45 (1), 39-53, 2017	298	2017
Copper toxicity and cyanobacteria ecology in the Sargasso Sea EL Mann, N Ahlgren, JW Moffett, SW Chisholm Limnology and oceanography 47 (4), 976-988, 2002	263	2002
Co-occurring Synechococcus ecotypes occupy four major oceanic regimes defined by temperature, macronutrients and iron JA Sohm, NA Ahlgren, ZJ Thomson, C Williams, JW Moffett, MA Saito, ... The ISME Journal 10 (2), 333-345, 2016	226	2016
Culture Isolation and Culture-Independent Clone Libraries Reveal New Marine Synechococcus Ecotypes with Distinctive Light and N Physiologies NA Ahlgren, G Rocap Applied and Environmental Microbiology 72 (11), 7193-7204, 2006	182	2006
Diversity and Distribution of Marine Synechococcus: Multiple Gene Phylogenies for Consensus Classification and Development of qPCR Assays for Sensitive … NA Ahlgren, G Rocap Frontiers in Microbiology 3, 213, 2012	174	2012
Aryl-homoserine lactone quorum sensing in stem-nodulating photosynthetic bradyrhizobia NA Ahlgren, CS Harwood, AL Schaefer, E Giraud, EP Greenberg Proceedings of the National Academy of Sciences 108 (17), 7183-7188, 2011	144	2011
Discovery of several novel, widespread, and ecologically distinct marine Thaumarchaeota viruses that encode amoC nitrification genes NA Ahlgren, CA Fuchsman, G Rocap, JA Fuhrman The ISME journal 13 (3), 618-631, 2019	124	2019
Measurement of Prochlorococcus ecotypes using real‐time polymerase chain reaction reveals different abundances of genotypes with similar light physiologies NA Ahlgren, G Rocap, SW Chisholm Environmental microbiology 8 (3), 441-454, 2006	122	2006
A network-based integrated framework for predicting virus–prokaryote interactions W Wang, J Ren, K Tang, E Dart, JC Ignacio-Espinoza, JA Fuhrman, ... NAR genomics and bioinformatics 2 (2), lqaa044, 2020	116	2020
Unraveling the functional dark matter through global metagenomics GA Pavlopoulos, FA Baltoumas, S Liu, O Selvitopi, AP Camargo, ... Nature 622 (7983), 594-602, 2023	88	2023
Long-term stability and Red Queen-like strain dynamics in marine viruses JC Ignacio-Espinoza, NA Ahlgren, JA Fuhrman Nature Microbiology 5 (2), 265-271, 2020	84	2020
Genome and epigenome of a novel marine Thaumarchaeota strain suggest viral infection, phosphorothioation DNA modification and multiple restriction systems NA Ahlgren, Y Chen, DM Needham, AE Parada, R Sachdeva, V Trinh, ... Environmental Microbiology 19 (6), 2434-2452, 2017	75	2017
Multi‐year dynamics of fine‐scale marine cyanobacterial populations are more strongly explained by phage interactions than abiotic, bottom‐up factors NA Ahlgren, JN Perelman, YC Yeh, JA Fuhrman Environmental Microbiology 21 (8), 2948-2963, 2019	57	2019
Prediction of virus-host infectious association by supervised learning methods M Zhang, L Yang, J Ren, NA Ahlgren, JA Fuhrman, F Sun BMC bioinformatics 18, 143-154, 2017	55	2017
The unique trace metal and mixed layer conditions of the Costa Rica upwelling dome support a distinct and dense community of Synechococcus NA Ahlgren, A Noble, AP Patton, K Roache‐Johnson, L Jackson, ... Limnology and Oceanography 59 (6), 2166-2184, 2014	54	2014
Optimizing de novo genome assembly from PCR-amplified metagenomes S Roux, G Trubl, D Goudeau, N Nath, E Couradeau, NA Ahlgren, Y Zhan, ... PeerJ 7, e6902, 2019	40	2019
Genomic mosaicism underlies the adaptation of marine Synechococcus ecotypes to distinct oceanic iron niches NA Ahlgren, BS Belisle, MD Lee Environmental Microbiology 22 (5), 1801-1815, 2020	39	2020

Järjestelmä ei voi suorittaa toimenpidettä nyt. Yritä myöhemmin uudelleen.

Artikkelit 1–20

Sitaatteja vuodessa

Päällekkäiset lähteet

Yhdistetyt sitaatit

Lisää muut kirjoittajatMuut kirjoittajat

Seuraa

Viittaukset

Muut kirjoittajat