Daniel McDonald

צוטט על ידי

	הכל	מאז 2020
ציטוטים ביבליוגרפיים	111355	71865
H-index	67	62
i10-index	129	118

15000

7500

3750

11250

20122013201420152016201720182019202020212022202320242025744 1513 2436 3688 5026 6356 8145 10662 12782 14747 14709 13395 13745 2462

גישה ציבורית

הצג הכל

123 מאמרים

4 מאמרים

זמין

לא זמין

על סמך ייפוי כח מהמממנים

מחברים משותפים

Rob KnightWolfe Family Chair at Rady Children's; Director, Center for Microbiome Innovation; Professor, UCSDכתובת אימייל מאומתת בדומיין ucsd.edu
Antonio GonzálezProgrammer Analyst, UC San Diegoכתובת אימייל מאומתת בדומיין ucsd.edu
J Gregory CaporasoNorthern Arizona Universityכתובת אימייל מאומתת בדומיין nau.edu
Yoshiki Vázquez-BaezaBiomeSenseכתובת אימייל מאומתת בדומיין biomesense.com
Pieter C DorresteinUCSDכתובת אימייל מאומתת בדומיין ucsd.edu
James T. Mortonכתובת אימייל מאומתת בדומיין gutzanalytics.com
Qiyun ZhuArizona State Universityכתובת אימייל מאומתת בדומיין asu.edu
Se Jin SongUniversity of California San Diegoכתובת אימייל מאומתת בדומיין ucsd.edu
Zhenjiang Zech Xustate key lab of food science and resources, nuכתובת אימייל מאומתת בדומיין ucsd.edu
Jesse RR ZaneveldAssociate Professor, Division of Biological Sciences, University of Washington, Bothellכתובת אימייל מאומתת בדומיין uw.edu
Jose C. ClementeAssociate Professor, Icahn School of Medicine at Mount Sinaiכתובת אימייל מאומתת בדומיין mssm.edu
Jai Ram RideoutOne Codexכתובת אימייל מאומתת בדומיין onecodex.com
Julia GoodrichGraduate Student, Cornell Universityכתובת אימייל מאומתת בדומיין cornell.edu
Curtis HuttenhowerDepartment of Biostatistics, Harvard School of Public Healthכתובת אימייל מאומתת בדומיין hsph.harvard.edu
Dan KnightsUniversity of Minnesotaכתובת אימייל מאומתת בדומיין umn.edu
Tomasz KościółekSano Centre for Computational Medicineכתובת אימייל מאומתת בדומיין sanoscience.org
Philip HugenholtzAustralian Centre for Ecogenomics, SCMB, The University of Queenslandכתובת אימייל מאומתת בדומיין uq.edu.au
Embriette HydeFreelance Science Writer and Research Consultantכתובת אימייל מאומתת בדומיין drhydenotjekyll.com
Jack A GilbertUniversity of California, San Diegoכתובת אימייל מאומתת בדומיין ucsd.edu
William A WaltersPost-doc, Cornell Universityכתובת אימייל מאומתת בדומיין colorado.edu

עקוב אחר

Daniel McDonald

American Gut, Knight Lab, Department of Pediatrics, UCSD

כתובת אימייל מאומתת בדומיין ucsd.edu - דף הבית

microbiome citizen science


כותרת מיון לפי ציטוט ביבליוגרפי מיון לפי שנה מיון לפי כותרת	צוטט על ידי צוטט על ידי	שנה
QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data‏ JG Caporaso, J Kuczynski, J Stombaugh, K Bittinger, FD Bushman, ...‏ Nature methods 7 (5), 335-336, 2010‏	36458	2010
Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2‏ E Bolyen, JR Rideout, MR Dillon, NA Bokulich, CC Abnet, GA Al-Ghalith, ...‏ Nature biotechnology 37 (8), 852-857, 2019‏	17610	2019
Structure, function and diversity of the healthy human microbiome‏ nature 486 (7402), 207-214, 2012‏	11022	2012
Predictive functional profiling of microbial communities using 16S rRNA marker gene sequences‏ MGI Langille, J Zaneveld, JG Caporaso, D McDonald, D Knights, ...‏ Nature biotechnology 31 (9), 814-821, 2013‏	9028	2013
An improved Greengenes taxonomy with explicit ranks for ecological and evolutionary analyses of bacteria and archaea‏ D McDonald, MN Price, J Goodrich, EP Nawrocki, TZ DeSantis, A Probst, ...‏ The ISME journal 6 (3), 610-618, 2012‏	5471	2012
The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn’s disease‏ D Gevers, S Kugathasan, LA Denson, Y Vázquez-Baeza, W Van Treuren, ...‏ Cell host & microbe 15 (3), 382-392, 2014‏	3549	2014
A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity‏ LR Thompson, JG Sanders, D McDonald, A Amir, J Ladau, KJ Locey, ...‏ Nature 551 (7681), 457-463, 2017‏	2528	2017
A framework for human microbiome research‏ Nature 486 (7402), 215-221, 2012‏	1780	2012
Best practices for analysing microbiomes‏ R Knight, A Vrbanac, BC Taylor, A Aksenov, C Callewaert, J Debelius, ...‏ Nature Reviews Microbiology 16 (7), 410-422, 2018‏	1690	2018
Deblur rapidly resolves single-nucleotide community sequence patterns‏ A Amir, D McDonald, JA Navas-Molina, E Kopylova, JT Morton, Z Zech Xu, ...‏ MSystems 2 (2), 10.1128/msystems. 00191-16, 2017‏	1547	2017
Strains, functions and dynamics in the expanded Human Microbiome Project‏ J Lloyd-Price, A Mahurkar, G Rahnavard, J Crabtree, J Orvis, AB Hall, ...‏ Nature 550 (7674), 61-66, 2017‏	1280	2017
Dynamics of the human gut microbiome in inflammatory bowel disease‏ J Halfvarson, CJ Brislawn, R Lamendella, Y Vázquez-Baeza, WA Walters, ...‏ Nature microbiology 2 (5), 1-7, 2017‏	1202	2017
QIIME 2: Reproducible, interactive, scalable, and extensible microbiome data science‏ E Bolyen, JR Rideout, MR Dillon, NA Bokulich, C Abnet, GA Al-Ghalith, ...‏ PeerJ Preprints, 2018‏	1044	2018
GABA-modulating bacteria of the human gut microbiota‏ P Strandwitz, KH Kim, D Terekhova, JK Liu, A Sharma, J Levering, ...‏ Nature microbiology 4 (3), 396-403, 2019‏	967	2019
Regional variation limits applications of healthy gut microbiome reference ranges and disease models‏ Y He, W Wu, HM Zheng, P Li, D McDonald, HF Sheng, MX Chen, ...‏ Nature medicine 24 (10), 1532-1535, 2018‏	834	2018
The Biological Observation Matrix (BIOM) format or: how I learned to stop worrying and love the ome-ome‏ D McDonald, JC Clemente, J Kuczynski, JR Rideout, J Stombaugh, ...‏ Gigascience 1 (1), 2047-217X-1-7, 2012‏	832	2012
Forensic identification using skin bacterial communities‏ N Fierer, CL Lauber, N Zhou, D McDonald, EK Costello, R Knight‏ Proceedings of the National Academy of Sciences 107 (14), 6477-6481, 2010‏	799	2010
American gut: an open platform for citizen science microbiome research‏ D McDonald, E Hyde, JW Debelius, JT Morton, A Gonzalez, G Ackermann, ...‏ Msystems 3 (3), 10.1128/msystems. 00031-18, 2018‏	775	2018
Subsampled open-reference clustering creates consistent, comprehensive OTU definitions and scales to billions of sequences‏ JR Rideout, Y He, JA Navas-Molina, WA Walters, LK Ursell, SM Gibbons, ...‏ PeerJ 2, e545, 2014‏	645	2014
Qiita: rapid, web-enabled microbiome meta-analysis‏ A Gonzalez, JA Navas-Molina, T Kosciolek, D McDonald, ...‏ Nature methods 15 (10), 796-798, 2018‏	612	2018

המערכת אינה יכולה לבצע את הפעולה כעת. נסה שוב מאוחר יותר.

מאמרים 1–20

ציטוטים ביבליוגרפיים בשנה

ציטוטים ביביליוגרפיים כפולים

ציטוטים ביביליוגרפיים שמוזגו

הוסף מחברים שותפיםמחברים משותפים

עקוב אחר

צוטט על ידי

מחברים משותפים