Daniel R. Mende

Geciteerd door

	Alles	Sinds 2020
Citaties	39611	21923
h-index	38	37
i10-index	47	46

4600

2300

1150

3450

2010201120122013201420152016201720182019202020212022202320242025168 590 1060 1422 1600 1932 2288 2474 2634 3127 3641 4149 4524 4339 4484 778

Openbare toegang

Alles bekijken

52 artikelen

0 artikelen

beschikbaar

niet beschikbaar

Op basis van financieringsmachtigingen

Medeauteurs

Peer BorkDirector of EMBL HeidelbergGeverifieerd e-mailadres voor embl.de
Shinichi SunagawaETH Zurich; Swiss Institute of BioinformaticsGeverifieerd e-mailadres voor ethz.ch
Jaime Huerta-CepasGroup Leader at CBGP (UPM-INIA-CSIC), Madrid, SpainGeverifieerd e-mailadres voor embl.de
Ivica Letunićbiobyte solutions GmbHGeverifieerd e-mailadres voor biobyte.de
Damian SzklarczykSIB Swiss Institute of Bioinformatics / University of ZurichGeverifieerd e-mailadres voor isb-sib.ch
edward francis delongProfessor, University of Hawaii, ManoaGeverifieerd e-mailadres voor hawaii.edu
Christian von MeringProfessor of Computational Biology, University of Zurich and Swiss Institute of BioinformaticsGeverifieerd e-mailadres voor imls.uzh.ch
Georg ZellerLUMC Leiden & EMBL HeidelbergGeverifieerd e-mailadres voor embl.de
Jens Roat KultimaDanish Competition and Consumer Agency; Bioinformatics and Economic Fraud SpecialistGeverifieerd e-mailadres voor kfst.dk
Manimozhiyan ArumugamAssociate Professor, Faculty of Health and Medical Sciences, University of CopenhagenGeverifieerd e-mailadres voor sund.ku.dk
Luis Pedro CoelhoCentre for Microbiome Research, Queensland University of TechnologyGeverifieerd e-mailadres voor qut.edu.au
Thomas Sebastian B. SchmidtSchool of Medicine & APC Microbiome, University College CorkGeverifieerd e-mailadres voor ucc.ie
Julien TapINRAE, Université Paris-SaclayGeverifieerd e-mailadres voor inrae.fr
Alison S. WallerBrock UniversityGeverifieerd e-mailadres voor brocku.ca
George WeinstockDirector of Microbial Genomics, Professor, Jackson LaboratoryGeverifieerd e-mailadres voor jax.org
Shamil SunyaevProfessor of Biomedical Informatics and of Medicine (BWH), Harvard Medical SchoolGeverifieerd e-mailadres voor rics.bwh.harvard.edu
Vera van Noortprofessor, KULeuvenGeverifieerd e-mailadres voor biw.kuleuven.be
Henrik Bjørn NielsenChief Scientific Officer, Clinical-Microbiomics A/SGeverifieerd e-mailadres voor clinical-microbiomics.com
Nassos TypasGroup Leader, EMBLGeverifieerd e-mailadres voor embl.de
Søren BrunakProfessor of Disease Systems Biology, University of CopenhagenGeverifieerd e-mailadres voor cpr.ku.dk

Volgen

Daniel R. Mende

Asst. Professor, Amsterdam University Medical Center, University of Amsterdam

Geverifieerd e-mailadres voor amsterdamumc.nl

Computational Biology Bioinformatics Evolution Clinical Microbiology


Titel Sorteren op citaties Sorteren op jaar Sorteren op titel	Geciteerd door Geciteerd door	Jaar
A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing J Qin, R Li, J Raes, M Arumugam, KS Burgdorf, C Manichanh, T Nielsen, ... nature 464 (7285), 59-65, 2010	13854	2010
Enterotypes of the human gut microbiome M Arumugam, J Raes, E Pelletier, D Le Paslier, T Yamada, DR Mende, ... nature 473 (7346), 174-180, 2011	8773	2011
eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology resource based on 5090 organisms and 2502 viruses J Huerta-Cepas, D Szklarczyk, D Heller, A Hernández-Plaza, SK Forslund, ... Nucleic acids research 47 (D1), D309-D314, 2019	3579	2019
Structure and function of the global ocean microbiome S Sunagawa, LP Coelho, S Chaffron, JR Kultima, K Labadie, G Salazar, ... Science 348 (6237), 1261359, 2015	2632	2015
eggNOG 4.5: a hierarchical orthology framework with improved functional annotations for eukaryotic, prokaryotic and viral sequences J Huerta-Cepas, D Szklarczyk, K Forslund, H Cook, D Heller, MC Walter, ... Nucleic acids research 44 (D1), D286-D293, 2016	2057	2016
Potential of fecal microbiota for early‐stage detection of colorectal cancer G Zeller, J Tap, AY Voigt, S Sunagawa, JR Kultima, PI Costea, A Amiot, ... Molecular systems biology 10 (11), 766, 2014	1206	2014
Genomic variation landscape of the human gut microbiome S Schloissnig, M Arumugam, S Sunagawa, M Mitreva, J Tap, A Zhu, ... Nature 493 (7430), 45-50, 2013	991	2013
Metabolic dependencies drive species co-occurrence in diverse microbial communities A Zelezniak, S Andrejev, O Ponomarova, DR Mende, P Bork, KR Patil Proceedings of the National Academy of Sciences 112 (20), 6449-6454, 2015	750	2015
Metagenomic species profiling using universal phylogenetic marker genes S Sunagawa, DR Mende, G Zeller, F Izquierdo-Carrasco, SA Berger, ... Nature methods 10 (12), 1196-1199, 2013	535	2013
Country-specific antibiotic use practices impact the human gut resistome K Forslund, S Sunagawa, JR Kultima, DR Mende, M Arumugam, A Typas, ... Genome research 23 (7), 1163-1169, 2013	467	2013
Microbial abundance, activity and population genomic profiling with mOTUs2 A Milanese, DR Mende, L Paoli, G Salazar, HJ Ruscheweyh, M Cuenca, ... Nature communications 10 (1), 1014, 2019	444	2019
Accurate and universal delineation of prokaryotic species DR Mende, S Sunagawa, G Zeller, P Bork Nature methods 10 (9), 881-884, 2013	339	2013
Assessment of metagenomic assembly using simulated next generation sequencing data DR Mende, AS Waller, S Sunagawa, AI Järvelin, MM Chan, M Arumugam, ... PloS one 7 (2), e31386, 2012	285	2012
Role for urea in nitrification by polar marine Archaea L Alonso-Sáez, AS Waller, DR Mende, K Bakker, H Farnelid, PL Yager, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 109 (44), 17989-17994, 2012	283	2012
Deciphering a global network of functionally associated post‐translational modifications P Minguez, L Parca, F Diella, DR Mende, R Kumar, M Helmer‐Citterich, ... Molecular systems biology 8 (1), 599, 2012	283	2012
Critical assessment of metagenome interpretation: the second round of challenges F Meyer, A Fritz, ZL Deng, D Koslicki, TR Lesker, A Gurevich, G Robertson, ... Nature methods 19 (4), 429-440, 2022	274	2022
MOCAT: a metagenomics assembly and gene prediction toolkit JR Kultima, S Sunagawa, J Li, W Chen, H Chen, DR Mende, ... Public Library of Science 7 (10), e47656, 2012	233	2012
Siderophore-based microbial adaptations to iron scarcity across the eastern Pacific Ocean RM Boiteau, DR Mende, NJ Hawco, MR McIlvin, JN Fitzsimmons, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 113 (50), 14237-14242, 2016	228	2016
Inter-individual differences in the gene content of human gut bacterial species A Zhu, S Sunagawa, DR Mende, P Bork Genome biology 16, 1-13, 2015	219	2015
GUNC: detection of chimerism and contamination in prokaryotic genomes A Orakov, A Fullam, LP Coelho, S Khedkar, D Szklarczyk, DR Mende, ... Genome biology 22, 1-19, 2021	176	2021

Het systeem kan de bewerking nu niet uitvoeren. Probeer het later opnieuw.

Artikelen 1–20

Citaties per jaar

Dubbele citaties

Samengevoegde citaties

Medeauteurs toevoegenMedeauteurs

Volgen

Geciteerd door

Medeauteurs