Katharina Hoff

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2020
Cytowania	7383	5078
h-indeks	24	22
i10-indeks	32	32

1600

800

400

1200

201020112012201320142015201620172018201920202021202220232024202539 31 67 170 182 278 317 342 371 455 537 720 869 1215 1530 203

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

34 artykuły

0 artykułów

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

Mario StankeProfessor of Bioinformatics, University of GreifswaldZweryfikowany adres z uni-greifswald.de
Mark BorodovskyRegents' Professor, Georgia TechZweryfikowany adres z gatech.edu
Alex LomsadzeSenior Research Scientist, The Wallace H. Coulter Department of Biomedical Engineering at GeorgiaZweryfikowany adres z gatech.edu
Thomas LingnerGenevention GmbHZweryfikowany adres z genevention.com
Peter MeinickeSenior Scientist, University of GoettingenZweryfikowany adres z gwdg.de
Philipp SchifferGroup Leader, The Worm Lab, University of CologneZweryfikowany adres z uni-koeln.de
Telford MJUniversity College LondonZweryfikowany adres z ucl.ac.uk
Braus, GerhardProfessor for Microbiology and Genetics, University of GoettingenZweryfikowany adres z gwdg.de
Dr. Harald KuschPostdoc, University Medical Center GöttingenZweryfikowany adres z med.uni-goettingen.de
Rolf DanielProfessor of Genomic and Applied Microbiology, Georg-August University GöttingenZweryfikowany adres z gwdg.de
Burkhard MorgensternProfessor of Bioinformatics, University of GöttingenZweryfikowany adres z gwdg.de
Pedro Martinez (ORCID: 0000-0003-3...Departament Genetica, Universitat BarcelonaZweryfikowany adres z ub.edu
Tonatiuh Peña CentenoGerman Center for Neurodegenerative DiseasesZweryfikowany adres z dzne.de
Hervé PhilippeUniversité de MontréalZweryfikowany adres z umontreal.ca
Van-Tuan TranFaculty of Biology, University of Science (HUS), Vietnam National University, HanoiZweryfikowany adres z vnu.edu.vn
Josep F Abril [ORCID: 0000-0001-779...Aggregate Professor; Dp Genetics, Microbiology & Statistics; Universitat de Barcelona (RoR021018s57)Zweryfikowany adres z ub.edu
Brenda Gavilán AguilarZweryfikowany adres z ub.edu

Obserwuj

Katharina Hoff

University of Greifswald

Zweryfikowany adres z uni-greifswald.de - Strona główna

Bioinformatics Gene Prediction Metagenomics Genome Annotation


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
BRAKER2: automatic eukaryotic genome annotation with GeneMark-EP+ and AUGUSTUS supported by a protein database T Brůna, KJ Hoff, A Lomsadze, M Stanke, M Borodovsky NAR genomics and bioinformatics 3 (1), lqaa108, 2021	1326	2021
Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimicry adaptations among species KK Dasmahapatra, JR Walters, AD Briscoe, JW Davey, A Whibley, ... Nature 487, 94-98, 2012	1248*	2012
BRAKER1: unsupervised RNA-Seq-based genome annotation with GeneMark-ET and AUGUSTUS KJ Hoff, S Lange, A Lomsadze, M Borodovsky, M Stanke Bioinformatics 32 (5), 767-769, 2016	1076	2016
Whole-Genome Annotation with BRAKER KJ Hoff, A Lomsadze, M Borodovsky, M Stanke Methods in Molecular Biology 1962, 65-95, 2019	645	2019
Finding the missing honey bee genes: lessons learned from a genome upgrade CG Elsik, KC Worley, AK Bennett, M Beye, F Camara, CP Childers, ... BMC genomics 15, 1-29, 2014	445	2014
The genomes of two key bumblebee species with primitive eusocial organization BM Sadd, SM Barribeau, G Bloch, DC De Graaf, P Dearden, CG Elsik, ... Genome biology 16, 1-32, 2015	412	2015
Predicting genes in single genomes with AUGUSTUS KJ Hoff, M Stanke Current protocols in bioinformatics 65 (1), e57, 2019	298	2019
WebAUGUSTUS—a web service for training AUGUSTUS and predicting genes in eukaryotes KJ Hoff, M Stanke Nucleic acids research 41 (W1), W123-W128, 2013	298	2013
TSEBRA: Transcript Selector for BRAKER L Gabriel, KJ Hoff, T Bruna, M Borodovsky, M Stanke BMC Bioinformatics 22, 556, 2021	175	2021
BRAKER3: Fully Automated Genome Annotation Using RNA-Seq and Protein Evidence with GeneMark-ETP, AUGUSTUS and TSEBRA L Gabriel, T Bruna, KJ Hoff, M Ebel, A Lomsadze, M Borodovsky, ... https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.10.544449v1, 2023	174	2023
Orphelia: predicting genes in metagenomic sequencing reads KJ Hoff, T Lingner, P Meinicke, M Tech Nucleic acids research 37 (suppl_2), W101-W105, 2009	174	2009
Mitigating Anticipated Effects of Systematic Errors Supports Sister-Group Relationship between Xenacoelomorpha and Ambulacraria H Philippe, AJ Poustka, M Chiodin, KJ Hoff, C Dessimoz, B Tomiczek, ... Current Biology, 2019	147	2019
Gene prediction in metagenomic fragments: a large scale machine learning approach KJ Hoff, M Tech, T Lingner, R Daniel, B Morgenstern, P Meinicke BMC bioinformatics 9, 1-14, 2008	140	2008
The effect of sequencing errors on metagenomic gene prediction KJ Hoff BMC genomics 10, 1-9, 2009	134	2009
Verticillium transcription activator of adhesion Vta2 suppresses microsclerotia formation and is required for systemic infection of plant roots VT Tran, SA Braus‐Stromeyer, H Kusch, M Reusche, A Kaever, A Kühn, ... New Phytologist 202 (2), 565-581, 2014	111	2014
Standards recommendations for the Earth BioGenome Project MKN Lawniczak, R Durbin, P Flicek, K Lindblad-Toh, X Wei, JM Archibald, ... Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of …, 2022	76	2022
Gene prediction: methods and protocols KJ Hoff, A Lomsadze, M Borodovsky, M Stanke, M Kollmar Springer, New York 1962, 65-95, 2019	61	2019
Chromosome-level reference genome of the European wasp spider Argiope bruennichi: a resource for studies on range expansion and evolutionary adaptation MM Sheffer, A Hoppe, H Krehenwinkel, G Uhl, AW Kuss, L Jensen, ... GigaScience 10 (1), giaa148, 2021	45	2021
The nervous system of Xenacoelomorpha: a genomic perspective E Perea-Atienza, B Gavilán, M Chiodin, JF Abril, KJ Hoff, AJ Poustka, ... Journal of Experimental Biology 218 (4), 618-628, 2015	45	2015
Galba: genome annotation with miniprot and AUGUSTUS T Brůna, H Li, J Guhlin, D Honsel, S Herbold, M Stanke, N Nenasheva, ... BMC bioinformatics 24 (1), 327, 2023	33	2023

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy