Steven Salzberg

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2020
Cytowania	371575	163786
h-indeks	166	102
i10-indeks	340	256

34000

17000

8500

25500

200020012002200320042005200620072008200920102011201220132014201520162017201820192020202120222023202420251255 3176 4367 5070 5596 5359 5640 5953 5822 6104 6538 7976 9688 11380 13919 16096 18464 21183 22982 26547 28651 32570 33321 32100 33091 4002

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

183 artykuły

0 artykułów

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

Mihaela PerteaAssociate Professor, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z jhu.edu
Ben LangmeadAssociate Professor of Computer Science, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z cs.jhu.edu
Daehwan KimOmphalos Lifesciences IncZweryfikowany adres z omphaloslifesci.com
Cole TrapnellAssociate Professor, Dept. of Genome Sciences, University of WashingtonZweryfikowany adres z uw.edu
Daniela PuiuJohns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z jhu.edu
Aleksey V ZiminResearch Scientist, Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins UnviersityZweryfikowany adres z jhu.edu
Mihai PopProfessor of Computer Science, University of Maryland, College ParkZweryfikowany adres z umd.edu
Owen WhiteDirector of Bioinformatics, Institute for Genome Sciences, Professor, Department of Epidemiology and Preventative, University ofZweryfikowany adres z som.umaryland.edu
Adam M. PhillippyDirector, Center for Genomics and Data Science Research, NHGRI, NIHZweryfikowany adres z nih.gov
Florian P BreitwieserPrincipal Software Engineer at SOPHiA GeneticsZweryfikowany adres z jhu.edu
Michael C. SchatzBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z cs.jhu.edu
David NealeUniversity California, Davis USDAZweryfikowany adres z ucdavis.edu
David R KelleyCalico LabsZweryfikowany adres z calicolabs.com
James YorkeDist. Univ. Research Prof of Math and Physics, Univ. of MarylandZweryfikowany adres z umd.edu
Jennifer Lu, Ph. D.Staff Scientist, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z jhmi.edu
Brian HaasBroad InstituteZweryfikowany adres z broadinstitute.org
Charles H. LangleyProfessor, University of California - DavisZweryfikowany adres z ucdavis.edu
Jonathan A. EisenProfessor, University of California, Davis (UC Davis), Department of Evolution and EcologyZweryfikowany adres z ucdavis.edu
Sreerama MurthyCEO & Chief Data Scientist, QuadratyxZweryfikowany adres z quadratyx.com
Derrick WoodBlackjack BiotechnologiesZweryfikowany adres z cs.jhu.edu

Obserwuj

Steven Salzberg

Bloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins University

Zweryfikowany adres z jhu.edu - Strona główna

Computational Biology Genomics Bioinformatics Metagenomics Biomedical Data Science


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
Fast gapped-read alignment with Bowtie 2 B Langmead, SL Salzberg Nature methods 9 (4), 357-359, 2012	51710	2012
Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome B Langmead, C Trapnell, M Pop, SL Salzberg Genome biology 10, 1-10, 2009	24305	2009
The sequence of the human genome JC Venter, MD Adams, EW Myers, PW Li, RJ Mural, et al. Science 291 (5507), 1304-1351, 2001	20964	2001
HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements D Kim, B Langmead, SL Salzberg Nature methods 12 (4), 357-360, 2015	19230	2015
Transcript assembly and quantification by RNA-Seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation C Trapnell, BA Williams, G Pertea, A Mortazavi, G Kwan, MJ Van Baren, ... Nature biotechnology 28 (5), 511-515, 2010	16060	2010
TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions D Kim, G Pertea, C Trapnell, H Pimentel, R Kelley, SL Salzberg Genome biology 14, 1-13, 2013	13673	2013
TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq C Trapnell, L Pachter, SL Salzberg Bioinformatics 25 (9), 1105-1111, 2009	13575	2009
FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies T Magoč, SL Salzberg Bioinformatics 27 (21), 2957-2963, 2011	13448	2011
Differential gene and transcript expression analysis of RNA-seq experiments with TopHat and Cufflinks C Trapnell, A Roberts, L Goff, G Pertea, D Kim, DR Kelley, H Pimentel, ... Nature protocols 7 (3), 562-578, 2012	13298	2012
Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. GI Arabidopsis Nature 408 (6814), 796, 2000	11333	2000
StringTie enables improved reconstruction of a transcriptome from RNA-seq reads M Pertea, GM Pertea, CM Antonescu, TC Chang, JT Mendell, SL Salzberg Nature biotechnology 33 (3), 290-295, 2015	10371	2015
Graph-based genome alignment and genotyping with HISAT2 and HISAT-genotype D Kim, JM Paggi, C Park, C Bennett, SL Salzberg Nature biotechnology 37 (8), 907-915, 2019	9556	2019
Versatile and open software for comparing large genomes S Kurtz, A Phillippy, AL Delcher, M Smoot, M Shumway, C Antonescu, ... Genome biology 5 (2), R12, 2004	5758	2004
Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum MJ Gardner, N Hall, E Fung, O White, M Berriman, RW Hyman, JM Carlton, ... Nature 419 (6906), 498-511, 2002	5578	2002
Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown M Pertea, D Kim, GM Pertea, JT Leek, SL Salzberg Nature protocols 11 (9), 1650-1667, 2016	5522	2016
Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments DE Wood, SL Salzberg Genome biology 15, 1-12, 2014	4613	2014
The transcriptional landscape of the mammalian genome P Carninci, T Kasukawa, S Katayama, J Gough, MC Frith, N Maeda, ... science 309 (5740), 1559-1563, 2005	4158	2005
Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer AL Delcher, KA Bratke, EC Powers, SL Salzberg Bioinformatics 23 (6), 673-679, 2007	3304	2007
Automated eukaryotic gene structure annotation using EVidenceModeler and the Program to Assemble Spliced Alignments BJ Haas, SL Salzberg, W Zhu, M Pertea, JE Allen, J Orvis, O White, ... Genome biology 9, 1-22, 2008	3031	2008
Improved microbial gene identification with GLIMMER AL Delcher, D Harmon, S Kasif, O White, SL Salzberg Nucleic acids research 27 (23), 4636-4641, 1999	3004	1999

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy