Pedro T. Monteiro

Citat de

	Toate	Din 2020
Referințe bibliografice	4570	2072
h-index	26	21
i10-index	44	35

480

240

120

360

2006200720082009201020112012201320142015201620172018201920202021202220232024202515 37 65 103 142 138 161 189 242 221 237 270 330 298 381 470 446 383 351 41

Acces public

Afișați-le pe toate

28 de articole

5 articole

disponibile

indisponibile

Pe baza cerințelor privind finanțarea

Coautori

Claudine ChaouiyaI2M UMR 7373, Aix Marseille University (France)Adresă de e-mail confirmată pe univ-amu.fr
Miguel Cacho TeixeiraFull Professor of Biological Sciences, Bioengineering Dept, Instituto Superior Técnico, UniversidadeAdresă de e-mail confirmată pe tecnico.ulisboa.pt
Isabel Sá-CorreiaDistinguished Professor, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa and iBBAdresă de e-mail confirmată pe tecnico.ulisboa.pt
Ana Teresa FreitasProfessor of Computer Science, INESC-ID, Instituto Superior Técnico, Universidade Técnica de LisboaAdresă de e-mail confirmată pe inesc-id.pt
Arlindo L OliveiraDistinguished Professor, Instituto Superior Técnico / INESC-IDAdresă de e-mail confirmată pe tecnico.ulisboa.pt
Denis ThieffryProfessor of Systems Biology, Institut de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (IBENS), ParisAdresă de e-mail confirmată pe ens.fr
Hidde de JongINRIAAdresă de e-mail confirmată pe inria.fr
Aurélien NaldiInria, FranceAdresă de e-mail confirmată pe inria.fr
João André CarriçobioMérieux Industry and Researcher, Faculty of Medicine, University of LisbonAdresă de e-mail confirmată pe fm.ul.pt
Ines LynceINESC-ID, Instituto Superior Técnico (IST), Universidade de LisboaAdresă de e-mail confirmată pe tecnico.ulisboa.pt
Alexandre LemosOutSystems, Instituto superior TécnicoAdresă de e-mail confirmată pe outsystems.com
Nuno P. MiraAssistant Professor, Instituto Superior TécnicoAdresă de e-mail confirmată pe ist.utl.pt
Mario RamirezProfessor of Microbiology, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, PortugalAdresă de e-mail confirmată pe fm.ul.pt
Wassim Abou-JaoudéCo-founder at GencoveryAdresă de e-mail confirmată pe gencovery.com
Margarida PalmaFood4Sustainability CoLabAdresă de e-mail confirmată pe food4sustainability.org
Pedro PaisPost-doctoral Researcher, iBB, ISTAdresă de e-mail confirmată pe tecnico.ulisboa.pt
Tomas HelikarEberhard Professor, Department of Biochemistry, University of Nebraska - LincolnAdresă de e-mail confirmată pe unl.edu
Delphine RopersInriaAdresă de e-mail confirmată pe inria.fr
Michel PageINRIA Grenoble, FranceAdresă de e-mail confirmată pe iae-grenoble.fr
Jorge S. OliveiraTécnico LisboaAdresă de e-mail confirmată pe tecnico.ulisboa.pt

Urmăriți

Pedro T. Monteiro

INESC-ID / IST - Universidade de Lisboa

Adresă de e-mail confirmată pe tecnico.ulisboa.pt - Pagina de pornire

Algorithms Computational Biology Formal Verification Biological Networks Discrete event systems


Titlu Sortați după descrierea bibliografică Sortați după an Sortați după titlu	Citat de Citat de	Anul
The YEASTRACT database: a tool for the analysis of transcription regulatory associations in Saccharomyces cerevisiae MC Teixeira, P Monteiro, P Jain, S Tenreiro, AR Fernandes, NP Mira, ... Nucleic acids research 34 (suppl 1), D446-D451, 2006	631	2006
PHYLOViZ: phylogenetic inference and data visualization for sequence based typing methods AP Francisco, C Vaz, PT Monteiro, J Melo-Cristino, M Ramirez, JA Carriço BMC bioinformatics 13 (1), 1-10, 2012	594	2012
The YEASTRACT database: an upgraded information system for the analysis of gene and genomic transcription regulation in Saccharomyces cerevisiae MC Teixeira, PT Monteiro, JF Guerreiro, JP Gonçalves, NP Mira, ... Nucleic acids research 42 (D1), D161-D166, 2014	286	2014
Logical modeling and dynamical analysis of cellular networks W Abou-Jaoudé, P Traynard, PT Monteiro, J Saez-Rodriguez, T Helikar, ... Frontiers in genetics 7, 94, 2016	258	2016
SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models SM Keating, D Waltemath, M König, F Zhang, A Dräger, C Chaouiya, ... Molecular systems biology 16 (8), e9110, 2020	254	2020
YEASTRACT: providing a programmatic access to curated transcriptional regulatory associations in Saccharomyces cerevisiae through a web services interface D Abdulrehman, PT Monteiro, MC Teixeira, NP Mira, AB Lourenço, ... Nucleic acids research 39 (suppl 1), D136-D140, 2011	240	2011
YEASTRACT+: a portal for cross-species comparative genomics of transcription regulation in yeasts PT Monteiro, J Oliveira, P Pais, M Antunes, M Palma, M Cavalheiro, ... Nucleic Acids Research 48 (D1), D642-D649, 2020	204	2020
YEASTRACT-DISCOVERER: new tools to improve the analysis of transcriptional regulatory associations in Saccharomyces cerevisiae PT Monteiro, ND Mendes, MC Teixeira, S d’Orey, S Tenreiro, NP Mira, ... Nucleic acids research 36 (suppl 1), D132-D136, 2008	203	2008
SBML qualitative models: a model representation format and infrastructure to foster interactions between qualitative modelling formalisms and tools C Chaouiya, D Bérenguier, SM Keating, A Naldi, MP Van Iersel, ... BMC systems biology 7 (1), 135, 2013	200	2013
YEASTRACT: an upgraded database for the analysis of transcription regulatory networks in Saccharomyces cerevisiae MC Teixeira, PT Monteiro, M Palma, C Costa, CP Godinho, P Pais, ... Nucleic acids research 46 (D1), D348-D353, 2018	193	2018
Temporal logic patterns for querying dynamic models of cellular interaction networks PT Monteiro, D Ropers, R Mateescu, AT Freitas, H De Jong Bioinformatics 24 (16), i227-i233, 2008	119	2008
Model checking to assess T-helper cell plasticity W Abou-Jaoudé, PT Monteiro, A Naldi, M Grandclaudon, V Soumelis, ... Frontiers in bioengineering and biotechnology 2, 86, 2015	115	2015
The CoLoMoTo interactive notebook: accessible and reproducible computational analyses for qualitative biological networks A Naldi, C Hernandez, N Levy, G Stoll, PT Monteiro, C Chaouiya, ... Frontiers in physiology 9, 680, 2018	104	2018
Cooperative development of logical modelling standards and tools with CoLoMoTo A Naldi, PT Monteiro, C Müssel, HA Kestler, D Thieffry, I Xenarios, ... Bioinformatics 31 (7), 1154-1159, 2015	104*	2015
Logical modeling and analysis of cellular regulatory networks with ginsim 3.0 A Naldi, C Hernandez, W Abou-Jaoudé, PT Monteiro, C Chaouiya, ... Frontiers in physiology 9, 646, 2018	101	2018
Efficient parameter search for qualitative models of regulatory networks using symbolic model checking G Batt, M Page, I Cantone, G Goessler, P Monteiro, H De Jong Bioinformatics 26 (18), i603-i610, 2010	90	2010
Dynamical modeling and analysis of large cellular regulatory networks D Bérenguier, C Chaouiya, PT Monteiro, A Naldi, E Remy, D Thieffry, ... Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science 23 (2), 2013	85	2013
YEASTRACT+: a portal for the exploitation of global transcription regulation and metabolic model data in yeast biotechnology and pathogenesis MC Teixeira, R Viana, M Palma, J Oliveira, M Galocha, MN Mota, ... Nucleic Acids Research 51 (D1), D785-D791, 2023	49	2023
The PathoYeastract database: an information system for the analysis of gene and genomic transcription regulation in pathogenic yeasts PT Monteiro, P Pais, C Costa, S Manna, I Sá-Correia, MC Teixeira Nucleic acids research 45 (D1), D597-D603, 2017	49	2017
Hybrid Epithelial–Mesenchymal Phenotypes Are Controlled by Microenvironmental Factors G Selvaggio, S Canato, A Pawar, PT Monteiro, PS Guerreiro, MM Brás, ... Cancer Research 80 (11), 2407-2420, 2020	47	2020

Sistemul nu poate realiza operația în acest moment. Încercați din nou mai târziu.

Articole 1–20

Referințe bibliografice pe an

Citate duplicat

Citate fuzionate

Adăugați coautoriCoautori

Urmăriți

Citat de

Coautori