Aleksey V Zimin

Посилання

	Усі	З 2020
Цитування	21582	11538
h-індекс	44	41
i10-індекс	62	57

2700

1350

675

2025

2007200820092010201120122013201420152016201720182019202020212022202320242025131 271 343 333 441 542 718 865 958 1026 1181 1307 1616 1697 2058 2273 2386 2699 413

Доступні для всіх

Переглянути всі

59 статей

0 статей

доступні

недоступні

За умовами фінансування

Співавтори

Steven SalzbergBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins UniversityПідтверджена електронна адреса в jhu.edu
James YorkeDist. Univ. Research Prof of Math and Physics, Univ. of MarylandПідтверджена електронна адреса в umd.edu
Daniela PuiuJohns Hopkins UniversityПідтверджена електронна адреса в jhu.edu
Guillaume MarçaisSystem ScientistПідтверджена електронна адреса в cs.cmu.edu
Brian R HuntUniversity of MarylandПідтверджена електронна адреса в umd.edu
Edward OttUniversity of MarylandПідтверджена електронна адреса в umd.edu
David NealeUniversity California, Davis USDAПідтверджена електронна адреса в ucdavis.edu
Geo PerteaData/Software Engineer, Lieber Institute for Brain DevelopmentПідтверджена електронна адреса в jhu.edu
Eugenia KalnayDistinguished University Professor, University of MarylandПідтверджена електронна адреса в umd.edu
Mihaela PerteaAssociate Professor, Johns Hopkins UniversityПідтверджена електронна адреса в jhu.edu
Jill WegrzynAssociate Professor in Ecology and Evolutionary Biology and Computational Biology Core DirectorПідтверджена електронна адреса в uconn.edu
Eric KostelichPresident's Professor of Mathematics, Arizona State UniversityПідтверджена електронна адреса в asu.edu
Charles H. LangleyProfessor, University of California - DavisПідтверджена електронна адреса в ucdavis.edu
Marc CrepeauПідтверджена електронна адреса в ucdavis.edu
Kristian A. StevensDepartments of Computer Science and Evolution and Ecology, UC DavisПідтверджена електронна адреса в ucdavis.edu
Winston TimpAssociate Professor, Johns Hopkins UniversityПідтверджена електронна адреса в jhu.edu
Adam M. PhillippyDirector, Center for Genomics and Data Science Research, NHGRI, NIHПідтверджена електронна адреса в nih.gov
Michael C. SchatzBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins UniversityПідтверджена електронна адреса в cs.jhu.edu
Matteo CorazzaENEAПідтверджена електронна адреса в enea.it
Pieter de JongCHORIПідтверджена електронна адреса в chori.org

Підписатись

Aleksey V Zimin

Research Scientist, Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins Unviersity

Підтверджена електронна адреса в jhu.edu - Домашня сторінка

bioinformatics genome assembly annotation alignment gene finding


Назва Сортувати за цитуваннями Сортувати за роком Сортувати за назвою	Посилання Посилання	Рік
Evolution of genes and genomes on the Drosophila phylogeny AG Clark, MB Eisen, DR Smith, CM Bergman, B Oliver, TA Markow, ... Nature 450 (7167), 203-18, 2007	2311	2007
MUMmer4: A fast and versatile genome alignment system G Marçais, AL Delcher, AM Phillippy, R Coston, SL Salzberg, A Zimin PLoS computational biology 14 (1), e1005944, 2018	1817	2018
The MaSuRCA genome assembler AV Zimin, G Marçais, D Puiu, M Roberts, SL Salzberg, JA Yorke Bioinformatics 29 (21), 2669-2677, 2013	1489	2013
Transcriptome assembly from long-read RNA-seq alignments with StringTie2 S Kovaka, AV Zimin, GM Pertea, R Razaghi, SL Salzberg, M Pertea Genome biology 20, 1-13, 2019	1384	2019
A whole-genome assembly of the domestic cow, Bos taurus AV Zimin, AL Delcher, L Florea, DR Kelley, MC Schatz, D Puiu, ... Genome biology 10, 1-10, 2009	1371	2009
Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimicry adaptations among species Nature 487 (7405), 94-98, 2012	1252	2012
A local ensemble Kalman filter for atmospheric data assimilation E Ott, BR Hunt, I Szunyogh, AV Zimin, EJ Kostelich, M Corazza, E Kalnay, ... Tellus A: Dynamic Meteorology and Oceanography 56 (5), 415-428, 2004	1077	2004
The Atlantic salmon genome provides insights into rediploidization S Lien, BF Koop, SR Sandve, JR Miller, MP Kent, T Nome, TR Hvidsten, ... Nature 533 (7602), 200-205, 2016	1067	2016
GAGE: A critical evaluation of genome assemblies and assembly algorithms SL Salzberg, AM Phillippy, A Zimin, D Puiu, T Magoc, S Koren, ... Genome research 22 (3), 557-567, 2012	900	2012
A draft human pangenome reference WW Liao, M Asri, J Ebler, D Doerr, M Haukness, G Hickey, S Lu, JK Lucas, ... Nature 617 (7960), 312-324, 2023	642	2023
Genome sequence of the progenitor of the wheat D genome Aegilops tauschii MC Luo, YQ Gu, D Puiu, H Wang, SO Twardziok, KR Deal, N Huo, T Zhu, ... Nature 551 (7681), 498-502, 2017	614	2017
Decoding the massive genome of loblolly pine using haploid DNA and novel assembly strategies DB Neale, JL Wegrzyn, KA Stevens, AV Zimin, D Puiu, MW Crepeau, ... Genome biology 15, 1-13, 2014	562	2014
De novo assembly of the cattle reference genome with single-molecule sequencing BD Rosen, DM Bickhart, RD Schnabel, S Koren, CG Elsik, E Tseng, ... Gigascience 9 (3), giaa021, 2020	529	2020
Multi-Platform Next-Generation Sequencing of the Domestic Turkey (Meleagris gallopavo): Genome Assembly and Analysis RA Dalloul, JA Long, AV Zimin, L Aslam, K Beal, L Ann Blomberg, ... PLoS biology 8 (9), e1000475, 2010	474	2010
Hybrid assembly of the large and highly repetitive genome of Aegilops tauschii, a progenitor of bread wheat, with the MaSuRCA mega-reads algorithm AV Zimin, D Puiu, MC Luo, T Zhu, S Koren, G Marçais, JA Yorke, J Dvořák, ... Genome research 27 (5), 787-792, 2017	439	2017
Sequencing and assembly of the 22-Gb loblolly pine genome A Zimin, KA Stevens, MW Crepeau, A Holtz-Morris, M Koriabine, ... Genetics 196 (3), 875-890, 2014	396	2014
The channel catfish genome sequence provides insights into the evolution of scale formation in teleosts Z Liu, S Liu, J Yao, L Bao, J Zhang, Y Li, C Jiang, L Sun, R Wang, ... Nature communications 7 (1), 11757, 2016	355	2016
Draft genome of the globally widespread and invasive Argentine ant (Linepithema humile) CD Smith, A Zimin, C Holt, E Abouheif, R Benton, E Cash, V Croset, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 108 (14), 5673-5678, 2011	333	2011
The first near-complete assembly of the hexaploid bread wheat genome, Triticum aestivum AV Zimin, D Puiu, R Hall, S Kingan, BJ Clavijo, SL Salzberg Gigascience 6 (11), gix097, 2017	310	2017
Draft genome of the red harvester ant Pogonomyrmex barbatus CR Smith, CD Smith, HM Robertson, M Helmkampf, A Zimin, M Yandell, ... Proceedings of the National Academy of Sciences 108 (14), 5667-5672, 2011	307	2011

У даний момент система не може виконати операцію. Спробуйте пізніше.

Статті 1–20

Кількість бібліографічних посилань на рік

Повторювані посилання

Об’єднані посилання

Додати співавторівСпівавтори

Підписатись

Посилання

Співавтори