On the number of -mers admitting a given lexicographical minimizer

F Ingels, C Marchet, M Salson - arxiv preprint arxiv:2412.17492, 2024 - arxiv.org
The minimizer of a word of size $ k $(a $ k $-mer) is defined as its smallest substring of size
$ m $(with $ m\leq k $), according to some ordering on $ m $-mers. minimizers have been …

Brisk: Exact resource-efficient dictionary for k-mers

C Smith, I Martayan, A Limasset, Y Dufresne - bioRxiv, 2024 - biorxiv.org
The rapid advancements in DNA sequencing technology have led to an unprecedented
increase in the generation of genomic datasets, with modern sequencers now capable of …

Compressione efficiente di k-mers sets: presentazione dei metodi e analisi comparativa

B BELLESSO - thesis.unipd.it
La quantità di dati prodotta dai laboratori bioinformatici cresce sempre più ogni anno,
stimando per il 2025 ordini dei zettabytes. Risulta quindi cruciale per la ricerca biologica e …